Деградирующие: деградирующий — это… Что такое деградирующий?

деградирующий — это… Что такое деградирующий?

деградирующий

деградирующий: разлагающийся, опускающийся, прогнивающий, гниющий, вырождающийся, загнивающий

деградирующий: прил., кол-во синонимов: 7

Синонимы:

деградированный
дегрессия

Полезное

Смотреть что такое «деградирующий» в других словарях:

гниющий — опускающийся, перегнивающий, загнаивающий, подгнивающий, истлевающий, разлагающийся, сопревающий, горящий, тлеющий, догнивающий, загнивающий, гниючий, преющий, смердящий, надгнивающий, сгорающий, сгнивающий, вырождающийся, деградирующий,… … Словарь синонимов
загнивающий — разлагающийся, преющий, протухающий, загнаивающий, опускающийся, тухнущий, горящий, деградирующий, тлеющий, гниющий, стагнирующий. Ant. расцветающий Словарь русских синонимов. загнивающий прил., кол во синонимов: 13 • гниющий (28) … Словарь синонимов
Орбелиани С.-С. — Орбелиани С. С. ОРБЕЛИАНИ Саба Сулхан (1658 1726) грузинский общественный деятель, литератор, лексикограф. Р. в семье феодала. Получил светское воспитание, был дипломатом при дворе грузинской династии. Литературно политическая деятельность О.… … Литературная энциклопедия
ПЕРВАЯ НОЧЬ ПОКОЯ — «ПЕРВАЯ НОЧЬ ПОКОЯ» (La Prima notte di quiete) Италия Франция, 1972, 105 мин. Французское название «ПРОФЕССОР» (Le Professeur). Драма. Даниеле Доминичи, слабый, безвольный, разочаровавшийся в жизни профессор филологии, который преподает в лицее в … Энциклопедия кино
вырождающийся — прил., кол во синонимов: 5 • гниющий (28) • дегенерирующий (3) • деградирующий (7) … Словарь синонимов
опускающийся — прил., кол во синонимов: 70 • выкидывающийся (19) • гниющий (28) • гнущийся (17) … Словарь синонимов
прогнивающий — прил., кол во синонимов: 7 • выгнивающий (2) • гниющий (28) • деградирующий (7) … Словарь синонимов
разлагающийся — прил., кол во синонимов: 32 • гнилой (48) • гниющий (28) • горящий (56) • … Словарь синонимов
мельчающий — прил., кол во синонимов: 3 • деградирующий (7) • дробнеющий (6) • уменьшающийся (6 … Словарь синонимов
НЕДОСТАТОЧНОСТЬ ФЕРМЕНТОВ — мед. Синдромы врождённых нарушений обмена веществ встречаются редко, но оказывают значительное влияние на физическое, интеллектуальное, психическое развитие и качество жизни (например, фенилкетонурия, гомоцистинурия, гликогенозы, синдромы ломкой… … Справочник по болезням

Десятилетие Организации Объединенных Наций, посвященное пустыням и борьбе с опустыниванием

Почему сейчас?

Засушливые земли занимают 41,3% всей поверхности суши. Это значительная часть земли, как видно из карты засушливых районов в приложении к этому набору документов.

Что было бы, если бы в мире не было засушливых земель?

Площадь засушливых земель: значительная часть суши

Засушливые земли занимают 41,3% поверхности земли. Это значительная доля земельных площадей, что не позволяет сбрасывать ее со счетов как бросовую землю. Следует учитывать и то, что эти районы пригодны для жилья, а часть оставшихся земель составляют в том числе и горы. В контексте устойчивого развития к засушливым районам принято относить засушливые, полузасушливые и сухие субгумидные районы и, как правило, не принято относить пустыни. На рис. 1 отражено распределение засушливых районов в мировом масштабе.

Принятое наименование		Площадь (млн. кв. км.)	Процент
Пустыня	Гипераридный	9.8	6.6
Полупустыня	Аридный	15.7	10.6
Степь	Семиаридный	22.6	15.2
Лугопастбище	Сухой субгумидный	12.8	8.7
Итого		60.9	41.3

Продовольственная безопасность: житница мира в опасности

До 44% культивируемых земель всего мира расположено в засушливых районах. Эндемичные для засушливых районов виды растений составляют 30% от общего количества выращиваемых в наши дни культур. В засушливых районах по-прежнему произрастают прародители этих растений и их дикие сородичи. Засушливые земли было принято использовать в основном для разведения скота, но их постепенно начинают преобразовывать в пахотные земли. Пастбищные угодья обеспечивают пропитанием 50% от общего поголовья скота в мире и являются средой обитания диких животных. В более засушливых зонах наиболее распространенным видом хозяйства является животноводство, в то время как в сухих субгумидных районах преобладают пахотные земли.

Бедность: отсутствие жизненных удобств

Опустынивание несет угрозу существованию более чем 1 млрд. человек, проживающих в 100 странах мира. Наиболее серьезно от опустынивания может пострадать до 1 млрд. наиболее бедных и маргинализированных слоев населения, проживающих в самым уязвимых районах. По результатам «Оценки на пороге тысячелетия», уровень человеческого благосостояния среди населения засушливых районов, в целом, ниже по сравнению с народами, проживающих в других экологических регионах. К примеру, по сравнению с другими экосистемами, засушливые районы характеризуются наиболее высоким уровнем младенческой смертности и наиболее низким валовым национальным продуктом (ВНП) на душу населения. Это означает, что в засушливых районах проживает население с относительно низким уровнем благосостояния.

Население: область проживания значительной доли населения мира

Общая численность населения засушливых районов составляет 2,1 млрд. человек, что означает, что на их территории проживает каждый третий житель современного мира. По данным ООН-Хабитат, темпы роста населения в засушливых районах, которые составляют 18,5%, превышают аналогичные показатели для любой другой экологической зоны. Плотность населения увеличивается по мере уменьшения засушливости и колеблется от 10 человек на квадратный километр в пустынях до 71 человек в сухих субгумидных (пастбищных) районах.

Экосистема	Общее число населения	Доля мирового населения
Пустыня	101,336	1.7
Полупустыня	242,780	4.1
Степь	855,333	14.4
Лугопастбища	909,972	15.3
Итого	2,109,421	35.5

Процесс деградации земель в засушливых районах называется опустыниванием. Принято считать, что вероятность опустынивания выше всего в регионах, находящихся приблизительно посередине между районами с высокой и низкой плотностью населения. Результаты исследования, проведенного в 2009 году Международным исследовательским институтом по разработке продовольственной политики, указывают на широкомасштабное восстановление лесов в густонаселенных областях Буркина-Фасо и Нигера при помощи низкозатратной восстановительной деятельности под управлением фермеров.

Водные ресурсы: вода исчезает, напряжение растет

Явление засушливости напрямую связано с наличием или нехваткой воды. Это оказывает непосредственное влияние на благосостояние человека, а также на две основные функции земельных угодий, а именно: первичное производство и переработку питательных веществ. Нехватка воды, разрыв между спросом и предложением, выше всего в засушливых районах. При этом уровень нехватки воды возрастает по мере увеличения засушливости. Для удовлетворения самых элементарных потребностей человеку требуется не менее 2000 кубометров воды в год. Население засушливых районов имеет доступ лишь к 1300 кубометров воды на человека, причем, согласно прогнозам, количество имеющейся воды будет только уменьшаться. На сегодняшний день проблема нехватки воды актуальна для 1–2 миллиардов человек, большинство из которых проживает в засушливых районах. По мере изменения климата, к 2030 году до половины населения мира будет проживать в районах, характеризующихся высокой нагрузкой на водные ресурсы. В некоторых засушливых и полузасушливых районах это приведет к перемещению населения в количестве от 24 млн. до 700 млн. человек.

Биоразнообразие: большое неизвестное

Численность различных видов живых организмов в засушливых районах остается неизвестной, так как до сегодняшнего дня не проводилось соответствующих оценок. Около 8% засушливых земель имеют охраняемый статус по сравнению с другими экосистемами, где средний показатель составляет около 10%. Согласно данным «Оценки на пороге тысячелетия», 8 из 25 «горячих точек» мира расположено в засушливых районах. К ним относятся области, где 0,5% видов растений являются эндемичными для региона при утрате среды обитания от 70% и выше.

Изменение климата: ненасытные поглотители углерода

Засушливые районы играют важнейшую роль в регулировании климата, как на местном, так и на глобальном уровне. Изменения в землепользовании приводят к выбросу парниковых газов в атмосферу, в то время как мелиорация почвы представляет собой, по сути, обратный процесс, при котором происходит поглощение почвой избыточного углерода из атмосферы. На территории засушливых районов хранится 46% от мировых запасов углерода, в их почве содержится 53% от глобального резерва углерода в почве, а в растениях — 14% от мировых запасов биотического углерода. Мероприятия по мелиорации земель, такие как мульчирование, компостирование, удобрение, смешанное возделывание культур и восстановление лесных массивов, приводящие к увеличению запасов углерода в почве, способны оказать непосредственное положительное влияние на процесс секвестрации углерода в почве. Эти методы также входят в комплекс технологий, известный как «Устойчивое управление земельными ресурсами» (см. ниже).

Деградация земель: суть вопроса

Опустынивание означает деградацию земель в засушливых, полузасушливых и субгумидных районах в результате действия различных факторов, включая изменение климата и деятельность человека. Деградация земель в засушливых регионах земного шара зачастую приводит к возникновению пустынных условий. Процессу деградации подвергается 24% земель во всем мире. Около 1,5 миллиарда людей находятся в прямой зависимости от деградирующих районов. При этом до 20% деградирующих земель составляют пахотные площади, а 20–25% — пастбищные угодья.

	Аридные и гипераридные	Семиаридные	Сухие субгумидные	Гумидные
Деградация	5%	9%	8%	78%

Естественное восстановление растительного покрова и почв в аридных (засушливых) районах требует в 5–10 раз больше времени по сравнению с более благоприятными регионами, характеризующимися большим количеством и большей регулярностью атмосферных осадков. В период с 1983 по 2003 годы была осуществлена мелиорация приблизительно 16% от общего количества земель, из которых 20% приходится на долю пахотных площадей, а 43% — на долю пастбищных угодий.

	Пахотные угодья	Пастбищные угодья	Леса	Во всем мире
Деградация земель	20%	20–25%	42%	24%
Восстановление земель	18%	43%	23%	16%

Факторы, приводящие к деградации земель

Процесс, приводящий к деградации земель в засушливых районах, нельзя назвать линейным, основанным на причинно-следственных связях, однако, его движущие факторы, которые находятся в сложном взаимодействии друг с другом, нам известны. Эти факторы подвержены изменениям с течением времени и различаются в зависимости от местности. К непосредственным факторам относятся климатические условия, в особенности, низкий уровень влажности почвы, распределение количества осадков и испарения. Косвенные факторы преимущественно связаны с жизнедеятельностью человека и включают в себя уровень бедности, используемые технологии, тенденции мирового и внутреннего рынка, социально-политическую динамику в обществе. Бедность является одновременно причиной и следствием процесса деградации земель.

Устойчивое управление земельными ресурсами: решение

Применение методов устойчивого управления земельными ресурсами способствует борьбе с опустыниванием, а также восстановлению и реабилитации земельных, почвенных, водных и растительных ресурсов. Устойчивое управление земельными ресурсами предполагает многофункциональное землепользование и противопоставляется монофункциональному использованию земельных ресурсов. Известно, что использование метода устойчивого управления земельными ресурсами позволяет повысить урожайность на 30–170%. С утрачиваемых ежегодно земельных площадей можно было бы получать 20 миллионов тонн зерна. Потеря дохода вследствие опустынивания и деградации земель составляет 42 млрд. долларов США в год.

Неорошаемые площади	8,2 млрд. долл. США
Пахотные площади	10,8 млрд. долл. США
Пастбищные площади	23,3 млрд. долл. США

Список литературы

Доклад 4-й Ассамблее ГЭФ, Новые достижения науки, новые возможности для ГЭФ-5 и последующего периода, 2010 г.
Международный исследовательский институт по разработке продовольственной политики. Документ для обсуждения 00914, Рейдж и др., Сельскохозяйственно-экологическая трансформация в странах Сахеля, 2009 г.
Фактологический бюллетень МФСР, 2009 г.
Доклад о глобальном использовании водных ресурсов «Вода в меняющемся мире», 2009 г.
КООНБО, Down to Earth, 2008 г.
Оценка экосистем на рубеже тысячелетия, 2005 г.

Анализ закономерностей деградации отдельных государственных высших учебных заведений

Подразделение: проектно-учебная лаборатория «Развитие университетов».

Руководители, команда проекта: Лисюткин Михаил Андреевич; Фрумин Исак Давидович; Козырева Ольга Михайловна.

Описание проекта и его актуальность

Сегодня во многих странах наблюдается стремительный рост масштабов высшего образования. Все больше государств встают в ряд стран с высокой степенью участия в высшем образовании (high participation systems). Этот процесс включает не только рост количества студентов, но и расширение и усложнение сети высшего образования, в том числе рост числа университетов.
Во всех странах с массовым высшим образованием появляется группа ведущих вузов, ориентированных на глобальную конкурентоспособность. В то же время под влиянием растущего спроса в таких системах формируется особый сегмент некачественного образования, или псевдообразования. Это приводит к необходимости создания государственной системы контроля качества работы университетов, выработке мер по борьбе с «плохими» вузами.
Однако в ходе реализации такой политики, во-первых, возникают серьезные трудности при обосновании критериев отнесения вузов к указанному сегменту; а во-вторых, реализуется принцип не «профилактики», а «хирургии», когда работа фактически идет со следствиями, а не с причинами. К примерам такой «хирургии» относятся и закрытия вузов, и, чаще, разнообразные слияния и поглощения.
Исходя из вышеизложенного, в борьбе с «плохими» вузами объектом оценки и анализа может стать динамика развития университетов, что должно позволить выработать не только диагностику риска необратимого снижения качества, но и меры профилактики.

Цель, задачи и предполагаемые результаты

Цель проекта: осмыслить теоретически и описать феномен, а также возможные внутренние и внешние причины деградации некоторых государственных университетов в России.

Задачи:

1. Проведение серии пилотных интервью с представителями потенциально деградирующих университетов для формирования предварительных гипотез.

2. Анализ количественных данных, характеризующих динамику развития государственных вузов в России для выявления вузов, результативность которых ухудшилась за последние три года (на основе результатов Мониторинга эффективности вузов Минобрнауки РФ).

3. Анализ литературы по истории развития системы высшего образования в России, институциональной теории, теории жизненных циклов организации, институциональному многообразию в высшем образовании.

4. Разработка модели организационной диагностики динамики развития и жизненного цикла вуза на основе теории жизненных циклов организации.

5. Анализ кейсов российских государственных вузов, деградирующих с точки зрения объективных показателей (не менее 5 кейсов).

6. Обобщение и концептуализация результатов исследования, формулировка выводов о внешних и внутренних факторах деградации некоторых государственных университетов в России.

Публикации по проекту: Лисюткин М.А., Фрумин И. Д. Как деградируют университеты: к постановке проблемы // Университетское управление: практика и анализ. 2014. № 4. С. 13-21.

Ключевые слова: деградирующие университеты; массовое высшее образование; жизненные циклы организации.

О. Мельниченко: Преобразование городских территорий требует поиска баланса интересов органов власти, коммерческих организаций и граждан

Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий обсудили в Совете Федерации.

Председатель Комитета Совета Федерации по федеративному устройству, региональной политике, местному самоуправлению и делам Севера Олег Мельниченко Мельниченко
Олег ВладимировичГубернатор Пензенской области провел «круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий».

Смотрите также

В заседании приняли участие сенаторы РФ, статс-секретарь – заместитель Министра строительства и жилищно-коммунального хозяйства РФ Татьяна Костарева, заместитель генерального директора ГК – Фонд содействия реформированию жилищно-коммунального хозяйства Олег Рурин, управляющий директор АО «ДОМ.РФ» Анатолий Азизов, Директор Департамента планирования территориального развития Министерства экономического развития РФ Виктор Смирнов, представители исполнительных органов государственной власти субъектов РФ, органов местного самоуправления, строительных компаний, общественных организаций и экспертного сообщества.

Участники «круглого стола» рассмотрели вопросы совершенствования правовых условий для проведения реновации жилищного фонда в регионах. В частности, обсуждался проект закона «О внесении изменений в Градостроительный кодекс РФ и отдельные законодательные акты РФ», внесенный в Государственную Думу сенаторами РФ Николаем Журавлевым, Журавлев
Николай Андреевичпредставитель от исполнительного органа государственной власти Костромской области Олегом Мельниченко, Андреем Шевченко, Шевченко
Андрей Анатольевичпредставитель от законодательного (представительного) органа государственной власти Оренбургской области депутатом Государственной Думы Евгением Москвичевым.

Обеспечение граждан доступным жильем, создание комфортной и качественной среды проживания является приоритетным направлением государственной политики

Олег Мельниченко отметил, что обеспечение граждан доступным жильем, создание комфортной и качественной среды проживания является приоритетным направлением государственной политики, которое закреплено в национальном проекте «Жилье и городская среда».

«По официальным данным Росстата, 75 процентов населения нашей страны проживает в городах. При этом большинство горожан сегодня живут в домах, построенных в первый период индустриального домостроения – в пятидесятые-семидесятые годы прошлого века. Очевидно, что такой жилищный фонд и коммунальная инфраструктура не отвечают современным требованиям, постепенно ветшают и переходят в аварийное состояние. Такие городские микрорайоны стали называть обидным, но точным названием – деградирующие территории», — сказал парламентарий.

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

1 из 24

Олег Мельниченко

2 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

3 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

4 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

5 из 24

Андрей Шевченко

6 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

7 из 24

Аркадий Чернецкий

8 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

9 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

10 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

11 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

12 из 24

Олег Мельниченко

13 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

14 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

15 из 24

Сергей Березкин

16 из 24

Дмитрий Кузьмин

17 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

18 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

19 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

20 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

21 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

22 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

23 из 24

«Круглый стол» на тему «Совершенствование законодательства в сфере комплексного развития территорий»

24 из 24

«В 2019 году наш Комитет провел мониторинг проблем, возникающих в субъектах РФ при реализации ими проектов комплексного развития территорий, который показал следующее: из‑за ограничения площади территории, предоставленной для реализации проекта, наблюдается его низкая экономическая рентабельность. В связи с наличием запрета на включение в такие территории ряда объектов (например, гаражей) реконструкция жилых кварталов и микрорайонов осложняется. Отсутствие механизма расселения жилых домов, не признанных аварийными, не позволяет в намеченные сроки осуществить процедуру переселения, если на это не согласен хотя бы один из собственников жилых помещений в таком доме. Таким образом, применение этих механизмов для обновления и благоустройства деградирующих территорий не стало носить повсеместного и комплексного характера».

Олег Мельниченко отметил, что деятельность по преобразованию городских территорий требует поиска баланса интересов органов публичной власти, коммерческих организаций и граждан. Так, органы публичной власти должны решать задачи по сокращению ветхого и аварийного жилья, обеспечения комфортной городской среды. Застройщики, являясь коммерческими организациями, преследуют цели увеличения прибыли при сокращении расходов. А граждане, проживающие на этих территориях из поколения в поколения, мечтают остаться жить здесь же, но в новых современных и комфортных условиях.

«В этой связи перед законодателем встала проблема выработать такие законодательные положения, которые обеспечили бы достижение баланса интересов власти, застройщиков и граждан при обеспечении гарантии соблюдения жилищных и имущественных прав наших граждан», — указал сенатор.

«Для решения этой задачи мы разработали проект федерального закона и 18 сентября этого года внесли его в Государственную Думу. За прошедший период на различных площадках прошли обсуждения предлагаемых нами новаций, мы выслушали мнение коллег и экспертов и сформулировали предложения, которые считаем целесообразным учесть при подготовке проекта ко второму чтению», — сказал Олег Мельниченко.

В частности, по его мнению, в проекте необходимо закрепить механизм обсуждения и согласования проекта решения органов публичной власти (Правительства РФ, высшего органа исполнительной власти субъекта РФ, органа местного самоуправления) о комплексном развитии территории. Это нужно, чтобы исключить конфликт между планами различных органов публичной власти по развитию определенной территории (прокладка коммуникаций, дорог, использование земельного участка под определенные публичные задачи).

Сенатор считает, что следует закрепить на федеральном уровне перечень критериев включения многоквартирных домов в проект адресной программы по их сносу и реконструкции. «В настоящее время проект устанавливает, что условия включения дома в эту программу определяется регионом. Полагаю, что на федеральном уровне должен быть установлен обязательный базовый перечень критериев, содержащий технические характеристики сносимых или реконструируемых объектов. Это такие характеристики, как уровень износа, техническое состояние, несоответствие современным требованиям к жилым помещениям, невозможность или нецелесообразность проведения капитального ремонта.

По мнению Олега Мельниченко, необходимо конкретизировать положения о территориальном нахождении жилого помещения, предоставляемого гражданам при переселении из многоквартирных домов в рамках реализации адресной программы по сносу и реконструкции многоквартирных домов.

Отдельно следует обсудить вопрос о механизмах финансовой поддержки регионов для реализации этих проектов, сказал сенатор. Он предложил обратиться к опыту реализации региональных программ по переселению граждан из аварийного жилья в части использования механизмов финансовой поддержки Фондом содействия реформированию жилищно-коммунального хозяйства на условиях софинансирования этих проектов. «Считаю, что при определенной проработке вопроса Фонд может являться инвестором для регионов при реализации таких проектов».

Татьяна Костарева затронула тему привлечения инвесторов к расселению аварийных домов, чтобы снять нагрузку с бюджета. По ее словам, Правительство РФ в настоящее время готовит отзыв на указанный законопроект. Она выразила уверенность, что документ будет концептуально поддержан.

Виктор Смирнов отметил, что Минэкономразвития РФ также поддерживает рассматриваемый законопроект, направленный на совершенствование механизмов расселения аварийного жилья и жилья, подлежащего сносу и реконструкции на основании адресных программ.

Комиссия Рижской думы по деградирующим среду зданиям классифицировала здание на улице А.Чака 34 как развалину категории В

В пятницу, 23 октября, комиссия Рижской думы по деградирующим среду зданиям классифицировала здание на улице А.Чака 34 как развалину категории В и применило к нему повышенную ставку налога на недвижимость.
Этот жилой дом, являющийся памятником архитектуры местного значения, принадлежит пяти собственникам. Здание находится на земельном участке площадью в 394 квадратных метра. Департамент городского имущества Рижской думы неоднократно обращался к собственникам, чтобы они начали работы по обновлению фасада, но ответ не был получен.
Деградирующее среду здание категории В означает угрожающее людям строение в потенциально опасном техническом состоянии, в котором констатированы очевидно износившиеся строительные конструкции, используется защитная сетка или похожее решение для фасада или других внешних конструкций, имеются повреждения в перекрытии крыши и системе отвода дождевой воды. В стенах здания или на цокольном этаже имеются трещины, сколы штукатурного слоя, вымывание связующих элементов.
Комиссия Рижской думы по деградирующим среду зданиям решила исключить из «списка развалин» здания, которые в настоящее время восстанавливаются. Например, здание на улице Дзирнаву 1, которое комиссия как развалину классифицировало в сентябре 2019 года. В настоящее время восстановлен фасад здания, с его элементов снята защитная сетка.
И у многоэтажного здания на улице Антонияс 13, которое как деградирующее среду здание категории В было классифицировано в ноябре 2018 года, в настоящее время восстановлен исторический фасад и предотвращены недостатки в содержании здания. Из списка вычеркнуто и одноэтажное каменное здание на улице Кр. Барона130, поскольку владельцы восстановили фасад здания.

Более подробная информация о деградирующих городскую среду Риги зданиях опубликована на: https://grausti.riga.lv/

Информацию подготовила: Байба Кантиня, координатор проектов отдела общественных отношений Рижской думы, тел.67181181, э-почта: [email protected]

«Без культуры деградирующие земли не возродить» ::: Хранители Наследия

«Без культуры деградирующие земли не возродить»

24.12.2018

Историко-культурные территории как компонент стратегии пространственного развития России

Евгения Твардовская

Российский институт стратегических исследований провел под занавес года еще один круглый стол из целой серии, посвященной историко-культурным территориям. На этот раз экспертам было предложено взглянуть на них как на компонент стратегии пространственного развития. И выяснилось, что под «любым соусом» развития пространства — как инновационного, сакрального, железнодорожного и даже пространства возрождения русского пчеловодства (а был на круглом столе и такой доклад) именно культурное наследие является точкой отсчета.

Олег Рыжков, руководитель Центра изучения, сохранения и развития историко-культурных территорий РИСИ, предложил сделать акцент на территории Русского Центра (ЦФО, Приволжский и Северо-Западный федеральный округ) и Русского Севера как наиболее важных с точки зрения государственного строительства. К сожалению, именно эти земли демонстрируют негативную тенденцию обезлюдевания. Понятно, что уходят люди – утрачивается и наследие. В других местах, куда идет приток миграции, происходит формирование областей высокой плотности населения, и там начинается трансформация коренного русского ландшафта в безликий городской ландшафт.

«Я предлагаю считать историко-культурными территориями (ИКТ) — территории в естественных границах коренных самобытных областей Русского Центра и Русского Севера, — сказал Олег Рыжков. — Это земли с необходимым и достаточным для ревитализации соотношением плотности сохранившихся подлинных элементов традиционного культурного ландшафта и элементов «постсоветского» и «глобального» ландшафтов. Сейчас РИСИ ведет разработку предложений по противодействию депопуляции территорий Русского Центра, находящихся за пределами сформировавшихся либо формирующихся агломераций. И по нашему предположению, инвестиции в ревитализацию на передовом технологическом уровне традиционного русского культурного ландшафта, в использование для формирования органической преемственности сохранившихся подлинных элементов наследия как опорной духовной и пространственно-визуальной матрицы, приведет к запуску процессов «самосоздания культурного ландшафта под влиянием ранее присущих ему культурных ценностей», количественного и качественного роста человеческого капитала».

То есть помощь наследию запустит процесс возрождения территорий. Одним из инструментов может стать построение локальной экономики гостеприимства.

Слайды из презентации. На втором — пространственный анализ распределения электрических источников света на территории Русского Центра и вблизи него. Налицо остановка в развитии дисперсной системы расселения, резкое расслоение территории по плотности населения, сжатие экономического пространства.

Владимир Каганский – старший научный сотрудник Института географии РАН, участник многих междисциплинарных исследований, автор работ в области герменевтики российского культурного ландшафта и постсоветского пространства – подтвердил, что ИКТ вполне могут стать опорами инновационного каркаса. Нужно искать новые формы, именно с опорой на культурное наследие. Строго говоря, формы эти не такие уж и новые – они известны, осталось осознать их «свойства» и создать такие же у нас – какие-то «с нуля», а какие-то – возродить…

«Нынче ВПК и наукограды не сработают. Вторых Сарова и Арзамаса больше не будет, — считает Владимир Каганский. – Можно вспомнить и исторические ландшафты, в которых генерировались инновации: города Европы XVII-XVIII вв., античной Греции, Германии XIX в. Все эти пространства были открыты, проницаемы, обеспечивались «креативным классом»: художниками, богословами, иконописцами. Эти территории были полицентрическими. Далее. Такой культурный ландшафт семантически насыщен и предлагает разнообразие занятий и событий. Понятно, что все это просто невозможно без сильного местного уровня власти и местного сообщества и самоуправления. Важно разнообразие таких центров и по сравнению с исторической Россией постсоветское пространство в этом плане убого. На что же мы можем опереться? Очевидно, что полицентризм не создается по указке сверху. Тип университетского города у нас не сформировался. Академгородки, увы, не были вписаны в общую национальную культуру, они были созданы для определенной цели, а потому сейчас прекращают свое существование. Но в России был сакральные центры, были значимые в культурном отношении помещичьи землевладения – как Ясная Поляна, сформировались заповедники. В России есть свой потенциал: разнообразие, скажем, курортных ландшафтов, а также возможность новых поселений или нового населения в старых местах. Мы изобретательны. И, кстати, «беловоротничковая преступность» — доказательство нашей изобретательности. В России еще множество поселений, которые вписаны в российскую культуру и сохраняют при этом ее материальные объекты. Целесообразно рассматривать их как точки роста и развития. Приведу яркий пример – Дом Пастернака в поселке Всеволодо-Вильва в Пермском крае. Там молодой поэт Борис Пастернак провел всего полгода в 1916 году. Дом был практически утрачен, но губернатор принял решение его восстановить в 2000-х. И теперь благодаря этому дому возрождается вся округа. Поселок зажил – только благодаря репутации места и культурному статусу. Стоит осуществлять проекты, которые попадают в резонанс с национальной культурой и интересами дня».

Дмитрий Наринский, вице-президент Союза архитекторов России, отметил, что задача пространственного развития России, поставленная Президентом в Послании Федеральному собранию в 2018 году – задача явно межведомственная, требующая рассмотрения многих составляющих с разных сторон.

«Однако Разработка проекта Стратегии пространственного развития (СПР) продемонстрировала не эффективность отраслевого подхода, т.к. Минэкономразвития не смог противостоять перекосу в сторону экономического аспекта рассмотрения вопроса. Из градостроительной деятельности сейчас вымывается стратегическая составляющая, из документов территориального планирования изъяты вопросы целеполагания. Если мы почитаем проект СПР, то не встретим там понятия объекта культурного наследия: только культурные ландшафты – в экологическом контексте — и историко-культурные заповедники. Основным механизмом реализации Стратегии пространственного развития Российской Федерации является комплексный план модернизации и расширения магистральной инфраструктуры до 2024 года – Комплексный инфраструктурный план. Но в нем к элементам магистральной инфраструктуры отнесены только объекты транспорта и энергетики! А как же быть с древними монастырями, музеями-заповедниками, другими объектами культурного наследия? Про них речь не идет вообще. Это говорит – увы – об абсолютном утилитаризме разработчиков Стратегии. Происходящие сейчас изменения с территориальным переподчинением Звенигорода лишний раз доказывают, что наследие нуждается в защите. И все чаще – от администрации».

Если мы хотим развивать креативные места, добавил Наринский, то туда должны стремиться креативные люди. А это уже зависит – от схемы управления такими территориями. И здесь недооцененным ресурсом являются так называемые межселенные территории. В качестве примера можно привести Талабские острова в Псковской области.

Слайды из презентации

То, что специалистам по наследию и культуре зачастую элементарно не хватает диалога и взаимодействия со специалистами из других ведомств – подтвердил и доктор архитектуры, член Президиума РААСН Игорь Бондаренко. Он отметил, что бывали случаи, когда Минобороны или Росатом, ссылаясь на секретность, просто отказывались сотрудничать с экспертами. Но как бы несерьезно не относились к представителям «культурных ведомств», без культуры деградирующие территории не возродить… И именно культура должна стать нашей идеологией. А без идеологии, заключил Бондаренко, никакой стратегии, в том числе и пространственного развития, быть не может.

Отличительной чертой обсуждений в стенах РИСИ является многопрофильность. И на этот раз по теме ИКТ предложили высказаться представителям Межведомственного координационного совета РАН «Транснациональное развитие Евразийского континента». Сейчас основной темой его деятельности является проект «Транссиб 2.0». Иван Стариков, руководитель Центра экономических стратегий Института экономики РАН, рассказал, что с момента образования Азиатско-Тихоокеанское партнерства значительно вырос объем перевозок товаров между Европой и Азией. К сожалению, Россия имеет в этом евразийском транзите незначительную долю. Новый Шелковый путь — создаваемая Китаем глобальная межконтинентальная транспортная система — прошел мимо нашей страны. Коллектив ученых подготовил комплексный «ответ» на эту ситуацию, основная тема которого — строительство высокоскоростной железнодорожной магистрали «Единая Евразия», по которой доставка грузов от Владивостока до Роттердама будет занимать двое-трое суток. Кроме того, очевидна целесообразность соединения современного железнодорожного комплекса с Северным морским путем и создание объединяющей их инфраструктуры. И здесь речь уже идет о возникновении глобальных мегарегионов.

«Однако планирование не должно быть голым технократическим. Фактор ИКТ должен быть учтен и должен стать нашим ресурсом. Мы приглашаем вас к сотрудничеству, так как специалистов по культурному наследию среди нас нет», — предложил Владимир Литвинцев, ученый секретарь совета «Транснациональное развитие Евразийского континента».

Слайды из презентации

Материалы круглого стола будут использованы сотрудниками РИСИ для работы. Ну а мы ждем следующих дискуссий на новой площадке в РИСИ, которую экспертам подарил уходящий 2018 год.

Аккредитоваться для участия можно по почте — [email protected]

Фото: РИСИ, материалы презентаций участников

Деградирующие игры / Интернет по лампочкам / Безопасный утюг

На Кузбасс FM «Мои документы» — новости изобретений и технологий, обзоры новинок интернет-магазинов. У микрофона Алексей Доронгов, здравствуйте. «Мои документы» выходят при поддержке компании «Электронные бизнес-системы».

Игровая реальность

Лицензионное программное обеспечение стоит дорого. Это касается не только профессиональных программ, но и видеоигр. Владельцы игровых приставок подтвердят: цена новинки достигает 20% стоимости самой консоли. Поэтому геймеры подходят к выбору очень обстоятельно: изучают отзывы критиков, читают специализированную прессу. Производителей компьютерных забав такое положение не устраивает: получается, продажи зависят от мнения узкого круга лиц. Поэтому недавно ими был найден нетривиальный выход, который даже получил патент. Суть в следующем: стоимость игры снижается в несколько раз, при этом покупатель получает полнофункциональную версию — чтобы самому оценить все преимущества новинки. Но пройти игру полностью вряд ли получится: со временем уменьшается количество противников, выбор оружия, а уровень сложности, напротив, увеличивается. И чтобы снова играть нормально, нужно оплатить полную цену. Первые игры с использованием деградирующей системы ознакомления поступят в продажу уже в этом году.

Просто фантастика

Никому сегодня не надо объяснять, что такое Wi-Fi. Беспроводной интернет уже не только в офисах, но и библиотеках, гостиницах и кафе. Современные стандарты позволяют передавать файлы «по воздуху» со скоростью до 300 мегабит. Казалось бы, что вам нужно ещё? А вот изобретателей из Германии не устраивает сам принцип передачи данных радиоволнами, а ещё им не нравится обязательное лицензирование Wi-Fi-устройств. Поэтому учёные придумали, как организовать компьютерную сеть при помощи бытовых светильников. Немцы обратили внимание на светодиодные лампы, которые не только светят, но при этом мерцают на очень большой частоте. Дело было за малым — научиться эту частоту регулировать и придумать, как колебания принимать. И то, и другое удалось: тестовая эксплуатация сети, построенной на лампочках, прошла успешно — в скором времени она будет представлена на международной выставке.

Умное железо

Многие из нас боятся оставить дома включённый утюг. И не зря боятся: по статистике, из-за неправильной эксплуатации электроприборов случается каждый пятый пожар. Именно поэтому изобретатели озадачились созданием противопожарного утюга — и добились определённых успехов. Модель по названием Roly Poly выполнена в необычном дизайне, который несёт не только эстетическую, но и сугубо практическую роль. Благодаря своей форме со смещённым центром тяжести утюг принимает безопасное вертикальное положение самостоятельно — стоит только его отпустить. К тому же, он оборудован специальным реле, которое отключает питание после десяти минут бездействия. К сожалению, в магазинах новинка ещё не появилась — но изобретатели активно над этим работают.

Другие новости изобретений и технологий — в следующем выпуске «Моих документов». С вами был Алексей Доронгов, до свидания. Программа подготовлена по материалам блогов и сетевых изданий — при поддержке компании «Электронные бизнес-системы».

Показать текст программы целиком

Аутофагия способствует уклонению иммунной системы от рака поджелудочной железы путем разложения MHC-I

Руни, М.С., Шукла, С.А., Ву, С.Дж., Гетц, Г. и Хакохен, Н. Молекулярные и генетические свойства опухолей, связанные с местным иммунным цитолитическим действием. деятельность. Cell 160 , 48–61 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

McGranahan, N. et al. Аллель-специфическая потеря HLA и ускользание от иммунитета в развитии рака легких. Cell 171 , 1259–1271 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rodig, S.J. et al. Белки MHC придают дифференциальную чувствительность к блокаде CTLA-4 и PD-1 при нелеченой метастатической меланоме. Sci. Пер. Med . 10 , eaar3342 (2018).

PubMed Google ученый

O’Reilly, E.M. et al. Дурвалумаб с тремелимумабом или без него для пациентов с метастатической аденокарциномой протока поджелудочной железы: рандомизированное клиническое исследование 2 фазы. JAMA Oncol . 5 , 1431–1438 (2019).

Google ученый

Waddell, N. et al. Полные геномы меняют мутационный ландшафт рака поджелудочной железы. Природа 518 , 495–501 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Ryschich, E. et al. Контроль опосредованного Т-клетками иммунного ответа с помощью HLA класса I при карциноме поджелудочной железы человека. Clin. Cancer Res . 11 , 498–504 (2005).

CAS PubMed Google ученый

Панда, Х., Ригг, А., Джон, Дж. И Лемуан, Н. Потеря экспрессии антиген-представляющих молекул в клеточных линиях рака поджелудочной железы человека и рака поджелудочной железы. Clin. Exp. Иммунол . 148 , 127–135 (2007).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Pommier, A. et al. Неразрешенный стресс эндоплазматического ретикулума порождает иммунорезистентные латентные метастазы рака поджелудочной железы. Наука 360 , eaao4908 (2018).

PubMed PubMed Central Google ученый

Yang, S. et al. Рак поджелудочной железы требует аутофагии для роста опухоли. Genes Dev . 25 , 717–729 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

10.

Yang, A. et al. Аутофагия имеет решающее значение для роста опухоли поджелудочной железы и прогрессирования опухолей с изменениями p53. Рак Дисков . 4 , 905–913 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

11.

Perera, R.M. et al. Транскрипционный контроль функции аутофагии-лизосомы управляет метаболизмом рака поджелудочной железы. Природа 524 , 361–365 (2015).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

12.

Ян А. и др. Аутофагия поддерживает рост рака поджелудочной железы с помощью как клеточно-автономных, так и неавтономных механизмов. Рак Дисков . 8 , 276–287 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

13.

Cunha, L. D. et al. Связанный с LC3 фагоцитоз миелоидных клеток способствует развитию иммунной толерантности опухоли. Cell 175 , 429–441 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

14.

Heckmann, B. L. et al. Эндоцитоз, связанный с LC3, облегчает клиренс бета-амилоида и снижает нейродегенерацию при болезни Альцгеймера у мышей. Cell 178 , 536–551 (2019).

CAS PubMed Google ученый

15.

Киркин В., МакЭван Д. Г., Новак И. и Дикич И. Роль убиквитина в селективной аутофагии. Мол. Ячейка 34 , 259–269 (2009).

CAS PubMed Google ученый

16.

Branon, T. C. et al. Эффективное бесконтактное маркирование живых клеток и организмов с помощью TurboID. Nat. Биотехнология . 36 , 880–887 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

17.

Киркин В. и др. Роль NBR1 в аутофагосомной деградации убиквитинированных субстратов. Мол. Ячейка 33 , 505–516 (2009).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

18.

Mosesson, Y.и другие. Эндоцитоз рецепторных тирозинкиназ вызывается моноубиквитилированием, а не полиубиквитилированием. J. Biol. Chem . 278 , 21323–21326 (2003).

CAS PubMed Google ученый

19.

Fujita, N. et al. Мутант Atg4B препятствует липидированию паралогов LC3 и вызывает дефекты закрытия аутофагосом. Мол. Биол. Ячейка 19 , 4651–4659 (2008).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

20.

Li, J. et al. Факторы, присущие опухолевым клеткам, лежат в основе гетерогенности инфильтрации иммунных клеток и ответа на иммунотерапию. Иммунитет 49 , 178–193 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

21.

Hildner, K. et al. Дефицит Batf3 показывает критическую роль дендритных клеток CD8α ⁺ в цитотоксическом Т-клеточном иммунитете. Наука 322 , 1097–1100 (2008).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

22.

Broz, M. L. et al. Рассечение миелоидного компартмента опухоли выявляет редкие активирующие антигенпрезентирующие клетки, критические для Т-клеточного иммунитета. Cancer Cell 26 , 638–652 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

23.

Спрангер, С., Дай, Д., Horton, B. & Gajewski, T. F. Постоянные в опухоли дендритные клетки Batf3 необходимы для транспортировки эффекторных Т-клеток и адоптивной Т-клеточной терапии. Cancer Cell 31 , 711–723 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

24.

Dangaj, D. et al. Сотрудничество между конститутивными и индуцибельными хемокинами обеспечивает приживление Т-клеток и иммунную атаку в солидных опухолях. Cancer Cell 35 , 885–900 (2019).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

25.

Boj, S. F. et al. Органоидные модели протокового рака поджелудочной железы человека и мыши. Cell 160 , 324–338 (2015).

CAS Google ученый

26.

Sakuishi, K. et al. Нацеливание на пути Tim-3 и PD-1 для обращения вспять истощения Т-клеток и восстановления противоопухолевого иммунитета. Дж.Exp. Med . 207 , 2187–2194 (2010).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

27.

Munster, T. et al. Зависимость концентрации гидроксихлорохина от реакции у пациентов с ревматоидным артритом. Rheum артрита . 46 , 1460–1469 (2002).

CAS PubMed Google ученый

28.

Карашич, Т.B. et al. Влияние гемцитабина и наб-паклитаксела с гидроксихлорохином или без него на пациентов с распространенным раком поджелудочной железы: рандомизированное клиническое испытание 2 фазы. JAMA Oncol . 5 , 993–998 (2019).

PubMed PubMed Central Google ученый

29.

Zeh, H. et al. Рандомизированное предоперационное исследование фазы II ингибирования аутофагии высокими дозами гидроксихлорохина и гемцитабина / наб-паклитаксела у пациентов с раком поджелудочной железы. Clin. Cancer Res . https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-19-4042 (2020).

30.

Маркосян Н. и др. EPHA2, присущий опухолевым клеткам, подавляет противоопухолевый иммунитет, регулируя PTGS2 (COX-2). J. Clin. Инвестируйте . 130 , 3594–3609 (2019).

Google ученый

31.

Sousa, C.M. et al. Звездчатые клетки поджелудочной железы поддерживают метаболизм опухоли за счет аутофагической секреции аланина. Природа 536 , 479–483 (2016).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

32.

Katheder, N. S. et al. Аутофагия в микросреде способствует росту опухоли. Природа 541 , 417–420 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

33.

Poillet-Perez, L. et al. Аутофагия поддерживает рост опухоли за счет циркулирующего аргинина. Природа 563 , 569–573 (2018).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

34.

Loi, M. et al. Белки макроаутофагии контролируют уровни MHC класса I на дендритных клетках и формируют противовирусные Т-клеточные ответы CD8 ⁺. Cell Rep . 15 , 1076–1087 (2016).

CAS PubMed Google ученый

35.

ДеВоркин Л. и др. Регулирование метаболизма аутофагией необходимо для противоопухолевого иммунитета Т-лимфоцитов CD8 ⁺. Cell Rep 27 , 502–513 (2019).

CAS PubMed Google ученый

36.

Старобинец Х. и др. Противоопухолевый адаптивный иммунитет остается неизменным после подавления аутофагии и противомалярийного лечения. J. Clin. Инвестируйте . 126 , 4417–4429 (2016).

PubMed PubMed Central Google ученый

37.

Xu, X. et al. Аутофагия необходима для выживания эффекторных CD8 ⁺ Т-клеток и формирования памяти. Nat. Иммунол . 15 , 1152–1161 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

38.

Lee, H. K. et al. Потребность in vivo в Atg5 при презентации антигена дендритными клетками. Иммунитет 32 , 227–239 (2010).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

39.

Michaud, M. et al. Зависимые от аутофагии противоопухолевые иммунные ответы, индуцированные химиотерапевтическими агентами у мышей. Наука 334 , 1573–1577 (2011).

ADS CAS PubMed Google ученый

40.

Moral, J. A. et al. ILC2 усиливают блокаду PD-1, активируя тканеспецифический иммунитет к раку. Природа 579 , 130–135 (2020).

ADS CAS PubMed Google ученый

41.

Уорд, Дж. П., Губин, М. М. и Шрайбер, Р. Д. Роль неоантигенов в естественных и терапевтически индуцированных иммунных ответах на рак. Adv. Иммунол . 130 , 25–74 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

42.

Лю Н., Фурукава Т., Кобари М. и Цао М. С. Сравнительные фенотипические исследования линий эпителиальных клеток протоков, полученных из нормальной поджелудочной железы человека и карциномы поджелудочной железы. г. Дж. Патол . 153 , 263–269 (1998).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

43.

Bardeesy, N. et al. Как путь p16 ^Ink4a, так и путь p19 ^Arf -p53 сдерживают прогрессирование аденокарциномы поджелудочной железы у мышей. Proc. Natl Acad. Sci. США 103 , 5947–5952 (2006).

ADS CAS PubMed Google ученый

44.

Kaizuka, T. et al. Зонд аутофагического потока, который запускает внутренний контроль. Мол. Ячейка 64 , 835–849 (2016).

CAS PubMed Google ученый

45.

Zoncu, R. et al. mTORC1 воспринимает лизосомальные аминокислоты по механизму вывернутого наизнанку, который требует вакуолярной H ⁺ -АТФазы. Наука 334 , 678–683 (2011).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

46.

Abu-Remaileh, M. et al. Лизосомная метаболомика выявляет V-ATPase- и mTOR-зависимую регуляцию оттока аминокислот из лизосом. Наука 358 , 807–813 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

47.

Matsuura, T. et al. Восстановление ex vivo на основе органоидов канцерогенеза протоков поджелудочной железы, вызванного Kras. Канцерогенез bgz122 (2019).

48.

Пауло, Дж. А., Гаун, А. и Гайджи, С. П. Глобальный анализ экспрессии белков и уровней фосфорилирования в обработанных никотином звездчатых клетках поджелудочной железы. J. Proteome Res . 14 , 4246–4256 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

49.

Biancur, D. E. et al. Компенсаторные метаболические сети при раке поджелудочной железы при нарушении метаболизма глутамина. Nat. Коммуна . 8 , 15965 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

50.

Navarrete-Perea, J., Yu, Q., Gygi, SP & Paulo, JA Протокол упрощенного тандемного массового тега (SL-TMT): эффективная стратегия для количественного (фосфо) протеомного профилирования с использованием тандемного массового тега -синхронный выбор предшественника-MS3. J. Proteome Res . 17 , 2226–2236 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

51.

McAlister, G.C. et al. MultiNotch MS3 обеспечивает точное, чувствительное и комплексное обнаружение дифференциальной экспрессии в протеомах линии раковых клеток. Анал. Chem . 86 , 7150–7158 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

52.

Soares, K. C. et al. Доклиническая мышиная модель метастазов в печени. J. Vis. Опыт . 51677 , 51677 (2014).

Google ученый

53.

Hirata, Y. et al. CD150 ^high Treg костного мозга поддерживают покой гемопоэтических стволовых клеток и иммунную привилегию посредством аденозина. Cell Stem Cell 22 , 445–453 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

54.

Gump, J. M. et al. Вариабельность аутофагии в клеточной популяции определяет судьбу клетки посредством избирательной деградации Fap-1. Nat. Ячейка Биол . 16 , 47–54 (2014).

CAS PubMed Google ученый

55.

Гамп, Дж. М. и Торберн, А. Сортировка клеток для базального и индуцированного аутофагического потока с помощью количественной ратиометрической проточной цитометрии. Аутофагия 10 , 1327–1334 (2014).

PubMed PubMed Central Google ученый

56.

Dobin, A. et al. STAR: сверхбыстрый универсальный выравниватель RNA-seq. Биоинформатика 29 , 15–21 (2013).

CAS PubMed Google ученый

57.

Liao, Y., Smyth, G. K. & Shi, W. featureCounts: эффективная программа общего назначения для сопоставления считываний последовательностей с геномными особенностями. Биоинформатика 30 , 923–930 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

58.

Subramanian, A. et al. Анализ обогащения набора генов: основанный на знаниях подход к интерпретации профилей экспрессии в масштабе всего генома. Proc. Natl Acad. Sci. США 102 , 15545–15550 (2005).

ADS CAS Google ученый

Подверженность унижающему достоинство по сравнению с неуниживающими музыкальными текстами и сексуальным поведением среди молодежи

Аннотация

ИСТОРИЯ ВОПРОСА. Ранняя половая жизнь — серьезная проблема в Соединенных Штатах.Недавний опрос показал, что большинство сексуально опытных подростков хотели бы, чтобы они дольше ждали начала полового акта; другие данные указывают на то, что незапланированная беременность и заболевания, передающиеся половым путем, чаще встречаются среди тех, кто раньше начинает половую жизнь. Популярная музыка может способствовать раннему сексу. Музыка — неотъемлемая часть жизни подростков. В среднем молодые люди слушают музыку от 1,5 до 2,5 часов в день. Сексуальные темы распространены в большей части этой музыки и варьируются от романтических и игривых до унизительных и враждебных.Хотя предыдущее лонгитюдное исследование связывало потребление музыкальных видеоклипов с рискованным сексуальным поведением, ни одно из предыдущих исследований не проверяло продольные связи между содержанием музыкальных текстов и последующими изменениями в сексуальном опыте, такими как начало полового акта, а также не изучали вопрос о том, подвержены ли различные виды воздействия. изображения секса имеют разные эффекты.

ДИЗАЙН И УЧАСТНИКИ. Мы провели национальный лонгитюдный телефонный опрос 1461 подростка. Участники были опрошены на исходном уровне (T1), когда им было от 12 до 17 лет, и снова через 1 и 3 года (T2 и T3).Во всех интервью участники сообщали о своем сексуальном опыте и отвечали на меры более чем дюжины факторов, которые, как известно, связаны с началом половой жизни у подростков. В общей сложности 1242 участника сообщили о своем сексуальном поведении во всех трех временных точках; подвыборка из 938 человек была идентифицирована как девственница до воздействия музыки для определенных анализов. Участники также указали, как часто они слушали каждого из более чем десятка музыкальных исполнителей, представляющих самые разные музыкальные жанры.Данные о привычках прослушивания были объединены с результатами анализа сексуального содержания песен каждого исполнителя для определения степени подверженности 2 видам сексуального содержания: унизительному и неунижающему.

РЕЗУЛЬТАТЫ МЕРЫ. Мы измерили начало полового акта и повышение уровня некоитальной сексуальной активности в течение 2-летнего периода.

РЕЗУЛЬТАТЫ. Многомерный регрессионный анализ показал, что молодые люди, которые слушали более унижающие сексуальные отношения в T2, с большей вероятностью впоследствии инициировали половой акт и перешли к более высоким уровням некоитальной сексуальной активности, даже после учета 18 характеристик респондентов, которые в противном случае могли бы объяснить эти отношения.Напротив, воздействие не унижающего достоинство сексуального содержания не было связано с изменениями в сексуальном поведении участников.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Прослушивание музыки с унижающими достоинство сексуальными текстами связано с развитием ряда сексуальных действий среди подростков, в то время как это не похоже на другие сексуальные тексты. Этот результат согласуется с теорией сексуального сценария и предполагает, что в основе эффекта могут лежать культурные представления об ожидаемом сексуальном поведении мужчин и женщин. Уменьшение количества унижающего достоинство сексуального содержания в популярной музыке или уменьшение воздействия музыки на молодых людей с помощью этого типа контента может помочь отсрочить начало сексуального поведения.

Определение для изучающих английский язык из словаря учащихся Merriam-Webster

^{деградировать
/ dɪˈgreɪd /
глагол

деградирует;
деградированный;
унижающий достоинство

деградирует;
деградированный;
унижающий достоинство

Определение DEGRADE для учащихся

1
[+ объект]
:
относиться к (кому-то или чему-то) плохо и без уважения

Группа обвиняет компанию в унижении женщин в своей рекламе.

Я не собираюсь унижать [= ниже ], отвечая на эти безосновательные обвинения.

Он чувствовал, что унижали своими замечаниями.

2
[+ объект]
:
чтобы ухудшить качество (чего-то)
3
технический
:
заставить (что-то сложное) распасться на простые вещества или части

[+ объект]

[нет объекта]

— унижающий достоинство
прилагательное
[более унизительно; самый унизительный]

CDM: Методологии
Описание ошибки
Ошибка сайта
Произошла ошибка при публикации этого ресурса.
Ресурс не найден
К сожалению, запрошенный ресурс не существует. Проверьте URL-адрес и повторите попытку.
Ресурс: https://cdm.unfccc.int/methodologies/armethodologies

Рекомендации по устранению неполадок

URL может быть неверным.
Параметры, переданные этому ресурсу, могут быть неверными.
Ресурс, на котором полагается этот ресурс, может быть
возникла ошибка.

Для получения более подробной информации об ошибке, пожалуйста,
см. журнал ошибок.

Если ошибка не исчезнет, обратитесь к разработчику сайта.
Спасибо за терпеливость.

NotFound (‘ Ошибка сайта
\ n Произошла ошибка при публикации этого ресурса. \ N
\ n Ресурс не найден \ n \ n К сожалению, запрошенный ресурс не существует.
Проверьте URL-адрес и повторите попытку.
Ресурс: https://cdm.unfccc.int/methodologies/armethodologies
\n
\ n \ n Рекомендации по устранению неполадок
\ n \ n \ n Возможно, URL-адрес неверен.
\ n Параметры, переданные этому ресурсу, могут быть неправильными.
\ n Ресурс, на который полагается этот ресурс, может \ n столкнуться с ошибкой.
\ n
\ n \ n Для получения более подробной информации об ошибке, пожалуйста, \ n обратитесь к ошибке бревно.\ n
\ n \ n Если ошибка не исчезнет, обратитесь к разработчику сайта. \ n Спасибо за терпение. \ n ‘,)
Что такое бесчеловечное и унижающее достоинство обращение?
Отношение к другим людям как к менее человеческим; причинение им страха, страданий и унижений — это нарушение человеческого достоинства. Каждый имеет право на свободу от бесчеловечного и унижающего достоинство обращения.
Что говорят правые?
Статья 3 Конвенции о правах человека защищает людей от пыток и бесчеловечного и унижающего достоинство обращения и наказания.В нем просто указано:
Никто не должен подвергаться ни пыткам, ни бесчеловечному или унижающему достоинство обращению или наказанию.

Права, закрепленные в Конвенции о правах человека, включая свободу от бесчеловечного и унижающего достоинство обращения, вступают в силу в законодательстве Великобритании через Закон о правах человека.
Как определяются «пытки» и «бесчеловечное и унижающее достоинство обращение»?

Пытки — это умышленное бесчеловечное обращение, причиняющее очень серьезные и жестокие страдания. Это страдание может быть психическим, физическим или сочетанием того и другого.Для того, чтобы его можно было квалифицировать как пытку, обращение должно достигать высокой степени жестокости.
Менее жестокие формы жестокого обращения также запрещены, если они «бесчеловечны» или «унижают достоинство», поскольку с нами нельзя обращаться так, как это ущемляет наше человеческое достоинство. Бесчеловечное обращение вызывает «сильные физические и психические страдания». Унизительное обращение «вызывает у жертвы чувство страха, боли и неполноценности, способное унизить и унизить жертву и, возможно, сломить ее или ее физическое или моральное сопротивление.’
Жестокое обращение должно превышать любые страдания, связанные с законно назначенным наказанием. Обстоятельства каждого случая (например, пол, возраст и состояние здоровья жертвы, продолжительность лечения и его физические и психические последствия) имеют значение. Суды ясно дали понять, что государство не обязательно должно иметь намерение , чтобы причиняли боль и страдания, чтобы нарушить статью 3.
Государства не должны делать ничего, что приводит к бесчеловечному или унижающему достоинство обращению, но также должны принимать разумные меры для предотвращения жестокого обращения, защиты лиц, подвергающихся непосредственному риску жестокого обращения, и предоставления средств правовой защиты в случае жестокого обращения.Это может означать, например, что должно быть проведено расследование при наличии достоверных утверждений о серьезном жестоком обращении со стороны государственных должностных лиц.
Могут ли когда-либо быть оправданы пытки или бесчеловечное обращение?

Многие права, закрепленные в Конвенции о правах человека, имеют встроенный механизм, устанавливающий, когда осуществление прав может быть обоснованно ограничено или нарушено. Например, статья 10 (свобода выражения мнения) гласит, что осуществление свободы выражения мнения может быть ограничено законом в целях защиты репутации или прав других лиц.Права, которые имеют эти встроенные механизмы ограничения, иногда называются квалифицированными правами .
Напротив, право на свободу от пыток и бесчеловечного или унижающего достоинство обращения в соответствии со статьей 3 рассматривается как абсолютное право — что означает, что нет никаких обстоятельств, при которых когда-либо было бы оправдано пытать кого-либо или обращаться с ним бесчеловечно, даже во время чрезвычайного положения или войны.
Но Великобритания никогда не нарушит статью 3, верно?

Неправильно.Есть несколько примеров нарушения Соединенным Королевством запрета на бесчеловечное и унижающее достоинство обращение.
Женщина-инвалид была приговорена к 7 суткам лишения свободы. Камера, в которую ее впервые поместили, не была приспособлена для инвалидов, и ее заставляли спать в инвалидном кресле. Тюремный персонал также с трудом помогал ей переходить в туалет и выходить из нее. Суд по правам человека заявил, что она стала жертвой унижающего достоинство обращения.
Отчим избил мальчика, в результате чего на коже мальчика остались хорошо заметные следы.В то время не существовало четких ограничений на то, насколько сильно родители могли бить своих детей в качестве «разумной меры наказания». Суд по правам человека установил, что закон не обеспечивает надлежащей защиты детей от обращения или наказания, противоречащего статье 3. Позднее в закон были внесены изменения, согласно которым нанесение детям ущерба всегда будет считаться преступлением, например, нарушение кожа или оставив стойкий красный след.
Некоторым просителям убежища правительство отказало в поддержке.Палата лордов Великобритании (ныне Верховный суд) установила, что, поскольку просителям убежища не разрешалось работать, отказ в поддержке подвергал их риску бездомности и бедности, нарушая их права по статье 3.
Это всего лишь несколько примеров. Нам нужно знать, каковы наши права, чтобы мы могли постоять за себя и других, чьи основные права человека нарушаются государством.
Для дополнительной информации:
Изображения: Pixabay.com и Pexels.com.
Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности.Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.
Настройка вашего браузера для приема файлов cookie
Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее частые причины:
В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки своего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файлы cookie.

Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г.,
браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.

Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie.Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

Почему этому сайту требуются файлы cookie?
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Чтобы предоставить доступ без файлов cookie
потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.

Что сохраняется в файле cookie?
Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.
Как правило, в файлах cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт
не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к
остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.
Новые IgG-деградирующие ферменты семейства протеаз IgdE связывают субстратную специфичность с тропизмом видов Streptococcus-хозяев
Abstract
Недавно мы обнаружили фермент, разрушающий IgG эндемичного патогена свиней S . suis обозначен как IgdE, который является высокоспецифичным для свиного IgG. Эта протеаза является членом-основателем нового семейства цистеиновых протеаз, которому в базе данных пептидаз MEROPS присвоено имя C113. Биоинформатический анализ выявил предполагаемых членов семейства протеаз IgdE у восьми других видов Streptococcus . Гены предполагаемых протеаз семейства IgdE S . agalactiae , S . porcinus , S . pseudoporcinus и S . equi subsp. zooepidemicus были клонированы для продукции рекомбинантного белка в векторы экспрессии. Рекомбинантные белки всех четырех протеаз семейства IgdE были протеолитически активны против IgG соответствующих хозяев Streptococcus , но не против IgG от других тестируемых видов или других классов иммуноглобулинов, тем самым связывая субстратную специфичность с известным тропизмом хозяина. Новые протеазы семейства IgdE S . agalactiae , S . pseudoporcinus и S . equi показал специфичность подтипа IgG, i . и . IgdE из S . agalactiae и S . pseudoporcinus расщепляет человеческий IgG1, а IgdE от S . equi был подтипом, специфичным для лошадиного IgG7. Специфичность подтипа свиного IgG протеаз семейства IgdE S . porcinus и S . pseudoporcinus еще предстоит определить.Расщепление свиного IgG с помощью IgdE S . Предполагается, что pseudoporcinus является эволюционно остающейся активностью, отражающей происхождение патогена человека от патогена свиней S . porcinus . Специфичность бактериальных протеаз к подтипу IgG указывает на особую важность этих подтипов IgG в противодействии инфекции или колонизации, а условно-патогенные стрептококки нейтрализуют такие антитела посредством экспрессии протеаз семейства IgdE как предполагаемых факторов иммунного уклонения.Мы предполагаем, что протеазы семейства IgdE могут быть действительными мишенями для вакцины против стрептококков как для человека, так и для ветеринарной медицины, а также могут иметь терапевтическое и биотехнологическое применение.
Образец цитирования: Spoerry C, Hessle P, Lewis MJ, Paton L, Woof JM, von Pawel-Rammingen U (2016) Новые ферменты, разрушающие IgG семейства протеаз IgdE, связывают субстратную специфичность с тропизмом хозяина видов Streptococcus . PLoS ONE 11 (10):
e0164809.
https: // doi.org / 10.1371 / journal.pone.0164809
Редактор: Адам Леснер, Университет Гданьски, ПОЛЬША
Поступила: 24 июня 2016 г .; Одобрена: 30 сентября 2016 г .; Опубликовано: 17 октября 2016 г.
Авторские права: © 2016 Spoerry et al. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.
Доступность данных: Все соответствующие данные находятся в документе.
Финансирование: Финансовая поддержка была предоставлена Фондом Карла Траггерса (CTS13-514) (www.carltryggersstiftelse.se/index.php?sida=rules&n=3) и Университетом Умео insamlingsstiftelse (2.1.12-1605-14) ( www.umu.se) в UPR, Wellcome Trust (074863) в JW при поддержке Kempestiftelsen (CS) и Школы медицинских исследований Шотландии (LP). Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.
Конкурирующие интересы: Мы ознакомились с политикой журнала, и у авторов этой рукописи есть следующие конкурирующие интересы: Подана заявка на патент [Новые стрептококковые протеазы, 1630021-2] на протеазы IgdE. CS и UPR указаны как изобретатели в этом приложении. Это не влияет на нашу приверженность политике PLOS ONE в отношении обмена данными и материалами.
Введение
Грамположительные бактерии рода Streptococcus тесно связаны с людьми и животными как комменсальные, условно-патогенные и патогенные бактерии.Часто стрептококки проявляют выраженный тропизм к хозяину, но эти бактерии также могут вызывать зоонозные или антропонозные инфекции у более необычных хозяев [1].
Начиная с наблюдения активности разложения иммуноглобулина (Ig) G в культуральных супернатантах важного эндемичного патогена свиней Streptococcus ( S .) suis , мы недавно идентифицировали новый фермент, разлагающий IgG, обозначенный как IgdE [2]. Благодаря скринингу ингибиторов, моделированию in silico, и мутационным исследованиям потенциальных остатков каталитической триады IgdE был признан цистеиновой протеазой.Эта протеаза не имеет гомологии ни с одной из ранее описанных протеаз и, таким образом, является членом-основателем нового семейства цистеиновых протеаз, обозначенного C113 в клане CA в базе данных пептидаз MEROPS (https://merops.sanger.ac.uk/) [3 ]. IgdE из S . suis является высокоспецифичным для свиного IgG, и никаких других субстратов идентифицировано не было. Иммунное уклонение от опосредованной Ig иммунной защиты, по-видимому, имеет особое значение для бактерий рода Streptococcus .Было идентифицировано несколько ферментов стрептококков, расщепляющих Ig, таких как IgG-специфические протеазы, IdeS из S . pyogenes [4], IdeZ S . equi subsp. zooepidemicus и IdeE S . equi subsp. equi [5]. Кроме того, IgA-специфические протеазы S . pneumoniae , S . oralis , S . sanguis и S . Был описан mitis [6, 7], а недавно мы описали IgM-специфическую протеазу в S . suis , обозначенный как IdeSsuis [8]. Большинство этих протеаз расщепляют тяжелую цепь молекул Ig в шарнирной области, тем самым нарушая все эффекторные функции Ig, кроме нейтрализации.
IgG — основное антитело в сыворотке большинства высших организмов [9, 10]. Человеческий IgG подразделяется на четыре различных подкласса; IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4 с численностью в том же порядке [11]. Эти подклассы имеют небольшие вариации в структуре, приводящие к различным эффекторным механизмам.IgG1 и IgG3 являются преобладающими классами Ig у людей, способными преодолевать плацентарный барьер для защиты плода и новорожденного путем пассивной иммунизации [12]. Каждый подкласс IgG имеет индивидуальный профиль связывания FcγR, при этом IgG1 и IgG3 эффективно связываются с большинством FcγR, тогда как IgG2 и IgG4 имеют пониженное сродство к некоторым FcγR [13]. IgG1 и IgG3 активизируют классический путь комплемента более эффективно по сравнению с IgG2 и IgG4 [14–16]. Следовательно, IgG1 и IgG3 больше участвуют в активации комплемента, связывании фагоцитов, сенсибилизации тучных клеток и сенсибилизации естественных клеток-киллеров для уничтожения, в то время как все четыре подкласса в равной степени участвуют в нейтрализации, опсонизации и внесосудистой диффузии [17].
Свиной IgG делится на шесть подклассов [18]. Эти подклассы считаются биохимически неразделимыми. Таким образом, различные подтипы IgG и их предполагаемые свойства можно предсказать только с помощью анализа последовательности [19]. IgG лошади делится на семь подклассов [20]. Экспериментальные исследования подклассов рекомбинантных лошадиных IgG показали, что IgG1, IgG3, IgG4 и IgG7 являются наиболее мощными активаторами классического пути комплемента через связывание C1q и вызывают также сильный респираторный выброс лейкоцитов периферической крови лошадей [21].
В этом исследовании мы провели тщательный поиск гомологии для идентификации нескольких гомологов IgdE S . suis у других видов Streptococcus в качестве предполагаемых протеаз семейства IgdE и сравнили их с помощью филогенетического анализа. Гены igdE из S . agalactiae , S . porcinus , S . pseudoporcinus и S . equi subsp. zooepidemicus клонировали для экспрессии и очистки рекомбинантного белка с последующим скринингом потенциальных субстратов этих предполагаемых протеаз.
С . agalactiae , также известный как стрептококк группы B , обычно встречается как комменсал у крупного рогатого скота и людей [22, 23], но также может вызывать мастит у коров [24] и мочеполовые инфекции, неонатальный сепсис, инфекции ЦНС. и эндокардит у человека [25].
С . porcinus — бактерия, наиболее часто встречающаяся в дыхательных путях свиней [26], связанная с лимфаденитом [27] и мертворождением [28]. С . pseudoporcinus недавно был выделен из S . porcinus как отдельный вид [29], и было показано, что это новый и распространенный организм, колонизирующий мочеполовые пути женщин [30].
С . equi subsp. zooepidemicus , комменсальный и условно-патогенный микроорганизм лошадей, а также других млекопитающих, может вызывать у людей тяжелые зоонозные инфекции, такие как сепсис, менингит и эндокардит [31].У лошадей S . equi subsp. zooepidemicus может вызывать несколько различных патологий, включая инфекции дыхательных путей, утериты и раневые инфекции. Причина высококонтагиозного заболевания верхних дыхательных путей душит, S . equi subsp. equi , как полагают, является клональным потомком предкового штамма S . equi subsp. zooepidemicus [32, 33].
Все предполагаемые протеазы семейства IgdE, протестированные в этом исследовании, показали ферментативную активность и субстратную специфичность для IgG конкретных хозяев.IgdE из S . agalactiae был специфичен к человеческому IgG1. IgdE из S . porcinus был специфичен для свиного IgG, а IgdE S . equi subsp. zooepidemicus был специфичен для лошадиного IgG7. IgdE из S . pseudoporcinus деградировал как человеческий IgG1, так и свиной IgG, тем самым являясь единственной идентифицированной протеазой семейства IgdE с множеством субстратов. Субстратная специфичность в отношении IgG вида хозяина этих новых членов семейства протеаз IgdE хорошо коррелирует с известным тропизмом хозяина соответствующих видов Streptococcus .Специфичность подкласса IgG этих протеаз может указывать на особую важность этих специфических подтипов IgG в иммунной защите против этих видов Streptococcus на определенных стадиях инфекции, которым бактерии могут противодействовать посредством экспрессии протеаз, специфичных для подтипа IgG.

Протеазы IgdE из S . agalactiae , S . porcinus , S . pseudoporcinus и S . equi subsp. zooepidemicus обозначены в этом исследовании IgdE _agalactiae, IgdE _porcinus, IgdE _{pseudoporcinus} и IgdE _equi.
Материалы и методы
Вычислительная идентификация новых членов семейства протеаз IgdE в Streptococci
Кодирующие последовательности всех доступных геномов Streptococcus были загружены с NCBI (ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/Bacteria/ 21 августа 2015 г.) и с PATRIC (ftp: // ftp.patricbrc.org/patric2/ от 25 августа 2015 г.). В качестве эталонной последовательности для протеазы IgdE используется последовательность RefSeq WP_014636499.1 из S . Использовалось suis . N-концевой сигнальный пептид и C-концевой участок присутствуют только в последовательностях из S . sui s были удалены, оставив аминокислоты 38–520, в дальнейшем называемые IgdE_доменом.
Домен IgdE_domain использовался в качестве последовательности запроса в поисках blastp (отсечка E-значения 1 для сохранения всех возможных протеаз) против последовательностей NCBI, а также последовательностей PATRIC.Последовательности, не содержащие каталитического цистеина, были исключены из дальнейшего рассмотрения. Многие из найденных последовательностей аннотированы как белки S-слоя или как содержащие домен W гомологии S-слоя. Они часто присутствуют в двух или более копиях в одном геноме и имеют мотив SxC или GxC в каталитическом сайте вместо мотив AxC, обнаруженный в 300–302 а.о. исходной последовательности IgdE S . suis . Чтобы отличить эти последовательности, которые не являются членами семейства протеаз IgdE, все последовательности, лишенные мотива AxC, также были удалены.
Полученные совпадения, в свою очередь, использовались в качестве последовательностей запросов к одним и тем же базам данных с использованием тех же параметров. Из списка совпадающих последовательностей были выбраны те, которые во втором раунде совпадали с областью, совпадающей в первом раунде, когда в качестве запроса использовался IgdE_domain. Последовательности, соответствующие модели Transglutcore с E-значением не более 1e-6, или последовательности, не содержащие каталитического мотива AxC, были исключены. Остальные последовательности были обрезаны с обоих концов, чтобы они содержали только части, соответствующие последовательности IgdE_domain.В случаях, когда это приводило к идентичным последовательностям, сохранялась только одна копия.
Филогенетический анализ
Clustal Omega версии 1.2.1 (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/) [34] использовался для генерации множественного выравнивания последовательностей, полученных выше, с использованием настроек по умолчанию. Для определения наиболее подходящей модели аминокислотной замены мы использовали ProtTest версии 3.4 [35]. Модель Джонса-Тейлора-Торнтона (JTT) с гамма-распределением, долей неизменных сайтов и наблюдаемыми частотами аминокислот была лучшей моделью и поэтому использовалась для построения дерева максимального правдоподобия (ML) с версией PhyML 20131022 [36] .Для оценки значимости филогенетической группировки был проведен бутстреп-анализ со 100 повторениями. Дерево было укоренено с использованием внешней группы, состоящей из двух последовательностей нестрептококковых белков, гомологичных IgdE_domain (WP_029500965.1; WP_016310821.1). Эти последовательности были обрезаны с обоих концов, чтобы они содержали только части, соответствующие последовательности IgdE_domain. Кодированные белки не имеют описанных функций. Филогенетическое дерево визуализировали с помощью iTOL (http://itol.embl.de/) [37].
Штаммы бактерий и условия роста
Штаммы Escherichia coli культивировали в бульоне лизогени (LB) или агаре лизогени (LA) в аэробных условиях при 30 ° C или 37 ° C.При необходимости добавляли 50 мкг / мл канамицина или 25 мкг / мл хлорамфеникола.
Клонирование гомологов IgdE для рекомбинантной экспрессии
Гены гомологов IgdE, лишенных сигнального пептида, амплифицировали из хромосомной ДНК S . porcinus штамм DSM20725 (любезно получен от Christoph G. Bauns, Колледж ветеринарной медицины, Университет Лейпцига, Лейпциг, Германия), S . pseudoporcinus штамм LQ940-04T (ATCC), S . agalactiae, , штамм CCUG420 (любезно полученный от Åsa Gylfe, Департамент клинической микробиологии, Университет Умео, Умео, Швеция) и S . equi subsp. zooepidemicus штамм 203 (любезно полученный из Национального ветеринарного института, Упсала, Швеция) в качестве матриц с использованием пар праймеров, указанных в таблице 1. Фрагменты ПЦР клонировали в pET_ZZ_1a после переваривания рестрикционными ферментами (все Thermo Scientific), обозначенными в названиях праймеров. Клонированные плазмиды проверяли секвенированием и трансформировали в E . coli BL21 (DE3) p LysS для рекомбинантной экспрессии белков.
Экспрессия и очистка рекомбинантных гомологов IgdE
Е . coli BL21 (DE3) p LysS изоляты, несущие pET_ZZ_1a igdE _porcinus, igdE _{pseudoporcinus}
19 _{pseudoporcinus}
19 910acdE 910e 910e 910 910e вырос до OD600 0.5 при 30 ° C. Экспрессию белка индуцировали 0,5 мМ IPTG в течение 5 часов при 30 ° C. Клетки лизировали на наличие неочищенных растворимых экстрактов с помощью реагента для экстракции белков BugBuster HT (Novagen) в соответствии с протоколом производства или лизировали ультразвуком в 20 мМ фосфате натрия, 0,5 М NaCl, 40 мМ имидазоле, pH 7,4 перед дальнейшей очисткой. Белки, меченные His-ZZ, очищали на HisTrap FF (GE Healthcare) с использованием стандартных протоколов. Метку удаляли ферментативным расщеплением Tev-протеазой в течение 20 часов при 4 ° C с последующим вторым раундом очистки на HisTrap FF (GE Healthcare).Проходящий поток, содержащий немеченый рекомбинантный белок, собирали и заменяли буфер на PBS. Концентрации белка определяли с помощью измерений Nanodrop A280 при соответствующих разведениях. В случае IgdE _equi не было достигнуто значительной сверхэкспрессии и попыток очистки не проводилось.
Скрининг на Ig-деградирующую активность рекомбинантных гомологов IgdE
Если не указано иное, все реакции проводили при 37 ° C в течение 16 часов в PBS. 20 мкг / мл очищенных рекомбинантных белков или 5% неочищенных растворимых экстрактов E . coli , экспрессирующие конструкции igdE , инкубировали с 0,5 мг / мл IgG свиньи, человека, крупного рогатого скота, лошади, козы и мыши (все Sigma), 0,25 мг / мл человеческого IgG1 каппа, IgG2 каппа, IgG3 каппа, IgG4 каппа. , IgA и IgM (все Sigma), 0,09 мг / мл очищенных рекомбинантных лошадиных IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgG5, IgG6 и IgG7, экспрессированных в клетках яичников китайского хомячка или клетках FreeStyle 293-F (согласно [21]) и 1 % человеческой плазмы, свиной плазмы (любезно полученной от Christoph G. Baums, Колледж ветеринарной медицины, Лейпцигский университет, Лейпциг, Германия) и лошадиной сыворотки (Sigma).Образцы реакции анализировали с помощью SDS-PAGE или вестерн-блоттинга. Эксперименты повторяли не менее двух раз, и показаны репрезентативные анализы.
SDS-PAGE и вестерн-блоттинг
Образцы для SDS-PAGE готовили с восстанавливающим буфером для образцов и нагревали до 95 ° C в течение 5 минут. 12% SDS-PAGE либо окрашивали кумасси синим (Sigma), гель-красителем с оранжевым белком Coomassie Fluor ^™ (Invitrogen), либо наносили блоттинг на PVDF-мембрану Hybond-P (GE Healthcare) для анализа вестерн-блоттингом.Мембраны блокировали 5% сухим молочным порошком в 0,1% PBS-Tween с последующей инкубацией с первичными антителами, конъюгированными с пероксидазой хрена, или неконъюгированными первичными антителами (согласно таблице 2). Мембраны тщательно промывали 0,1% PBS-Tween и проявляли реагентом для обнаружения вестерн-блоттинга Amersham ECL Select (GE Healthcare) в соответствии с инструкциями производителя, и хемилюминесцентный сигнал регистрировали системой визуализации LAS4000 (Fujifilm). Предварительно окрашенные белковые лестницы были изображены с помощью той же системы при стандартном эпибелом освещении.
N-концевое секвенирование по Эдману
реакций разложения IgG разделяли с помощью SDS-PAGE, как объяснялось ранее, и переносили на мембрану для блоттинга PVDF (GE Health Care) полусухим блоттингом с буфером для блоттинга, состоящим из 50 мМ бората натрия и 20% метанола. Мембрану окрашивали Ponceau S 0,5% (Sigma) 1% уксусной кислотой в воде MQ и обесцвечивали водой MQ. Мембрана была быстро высушена, после чего аккуратно вырезан продукт разложения. N-концевое секвенирование по Эдману продукта деградации было выполнено Proteome Factory (Берлин, Германия).Поиски гомологии BLAST использовали для определения положения полученной последовательности в молекуле IgG.
Результаты
Предполагаемые протеазы семейства IgdE распространены среди нескольких видов
Streptococcus
Для идентификации новых протеаз семейства IgdE в геномах стрептококков был проведен поиск последовательностей, кодирующих гомологи домена IgdE_. Домен IgdE_ был определен как аминокислоты 38–520 последовательности RefSeq WP_014636499.1 из S . suis 05ZYh43, тем самым исключая N-концевой сигнальный пептид и C-концевую область, присутствующую только в последовательностях из S . sui s. Только последовательности, которые при использовании в качестве запроса во втором раунде поисков гомологии имели перекрытие с областью, сопоставленной в первом раунде и несущие консервативный каталитический остаток цистеина, были оставлены для дальнейшего анализа (таблица 3).
После поиска гомологии и этапов фильтрации было идентифицировано 55 уникальных последовательностей, представляющих предполагаемые протеазы семейства IgdE, 23 из S . suis , 18 из S. agalactiae , пять из S . dysgalactiae , три из S . equi subsp. zooepidemicus и по одному из S . porcinus , S . pseudoporcinus , S . canis и S . castoreus соответственно. Две последовательности из одного генома S . Было идентифицировано merionis . Все последовательности из S . agalactiae очень похожи в определенной области IgdE_domain, часто различаются только одним или несколькими аминокислотными положениями.
Чтобы проиллюстрировать взаимосвязь этих 55 последовательностей, филогенетическое дерево было выведено методом максимального правдоподобия на основе JTT-модели эволюции последовательностей (Рис. 1). Последовательности области IgdE_domain S . canis и S . castoreus показал сходство с последовательностями области IgdE_domain S . дисгалактии . Две последовательности IgdE_domain S . merionis сгруппированы вместе, но по-прежнему отличаются друг от друга.Последовательности области IgdE_домена всех S . agalactiae, штаммов сгруппированы близко друг к другу, как и последовательности S . equi и S . dysgalactiae , а последовательности S . suis были более разнообразными. Также две последовательности получены из S . porcinus и S . pseudoporcinus сгруппированы близко друг к другу.
Рис. 1. Филогенетическое дерево идентифицированных предполагаемых протеаз IgdE.
Филогенетический анализ домена IgdE_ 55 выявил предполагаемые протеазы IgdE. Дерево максимального правдоподобия (ML) было построено с использованием модели Джонса-Тейлора-Торнтона (JTT) с PhyML. Отображаются значения начальной загрузки больше или равные 80%. Предполагаемые последовательности протеазы IgdE, которые соответствуют клонированным генам для экспрессии рекомбинантного белка, обозначены жирным шрифтом . Масштаб дерева представлен как среднее количество замен на сайт.

https: // doi.org / 10.1371 / journal.pone.0164809.g001
Расположение
генов igdE в геномах Streptococcus
Каждый ген, кодирующий предполагаемую протеазу IgdE, был локализован в соответствующем геноме, а также гены, фланкирующие ген igdE (таблица 4). Расположение генов igdE обычно сохранялось внутри видов, хотя два из 18 генов S . agalactiae, штаммов и один из 23 штаммов S . Штаммы suis имели девиантные соседние гены.Местоположение и соседние гены были консервативными между видами S . кастореус , S . canis и S . дисгалактии . Для последовательностей, извлеченных из проектов генома, местоположения не могли быть определены или могли быть только приблизительно.
Протеазы семейства IgdE высокоспецифичны к IgG разных видов хозяев
Гены igdE из одного репрезентативного штамма S . agalactiae , S . porcinus , S . pseudoporcinus и S . equi subsp. zooepidemicus (соответствующие последовательностям, обозначенным полужирным шрифтом на фиг. 1) клонировали в векторы экспрессии в E . coli . Кодируемые белки были сверхэкспрессированы, и рекомбинантный белок использовали для скрининга субстратов путем инкубации в течение ночи с потенциальными субстратами перед анализами с помощью SDS-PAGE и вестерн-блоттинга.
Рекомбинантный IgdE _agalactiae был способен расщеплять человеческий IgG, и продукт диагностического расщепления 32 кДа появлялся при инкубации rIgdE _agalactiae с человеческим IgG, но не при инкубации со свиным, бычьим, лошадиным, козьим или мышиным IgG (рис. 2А).Подобно тому, что rIgdE _porcinus был способен разрушать только IgG свиньи; диагностический продукт расщепления 32 кДа появлялся только при инкубации с IgG свиньи, но не при инкубации с IgG человека, крупного рогатого скота, лошади, козы или мыши (фиг. 2B). Рекомбинантный IgdE _{pseudoporcinus}, напротив, имел двойную субстратную специфичность по отношению к человеческому и свиному IgG, снова характеризуемую появлением диагностических продуктов расщепления 32 кДа, в то время как не наблюдалось разрушения бычьего, лошадиного, козьего или мышиного IgG (рис. 2С).Рекомбинантный IgdE _equi обладал разрушающей активностью против лошадиного IgG, в то время как не наблюдалось деградации человеческого, свиного, бычьего, козьего или мышиного IgG (фиг. 2D).
Рис. 2. Видовая специфичность IgG-хозяев протеаз семейства IgdE.
0,5 мг / мл IgG человека, свиньи, лошади, крупного рогатого скота и мыши инкубировали в течение 16 часов при 37 ° C с (A) 20 мкг / мл очищенного rIgdE _agalactiae, (B) 20 мкг / мл очищенного rIgdE _porcinus , (C) 5% растворимая фракция E .Клетки coli , экспрессирующие rIgdE _{pseudoporcinu} s, (D) 5% растворимая фракция E . Клетки coli , экспрессирующие rIgdE _equi. PBS (A и B) или 5% растворимая фракция клеток E. coli без рекомбинантной конструкции (C и D) использовали в качестве отрицательного контроля (-). Реакции анализировали с помощью SDS-PAGE кумасси синего в восстанавливающих условиях. Изображения разных параллельных запусков SDS-PAGE были собраны в один рисунок. Диагностический продукт расщепления IgG 32 кДа (*) появлялся при инкубации rIgdE _agalactiae с человеческим IgG, rIgdE _porcinus с свиным IgG, rIgdE _{pseudoporcinus} с человеческим IgG и свиного IgG10 и rIgd 910 лошадиных сил.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0164809.g002
Специфичность IgG этих новых членов семейства протеаз IgdE исследовали путем инкубации рекомбинантного белка со свиньей и лошадиной сывороткой соответственно. Эти реакции расщепления анализировали с помощью вестерн-блоттинга анти-IgG, анти-IgM и анти-IgA. Рекомбинантный IgdE _porcinus деградировал IgG свиньи, но не IgM или IgA (рис. 3A). Аналогичное наблюдение было сделано при инкубации сыворотки с rIgdE _{pseudoporcinus} (рис. 3B), который также был специфичным для IgG.Рекомбинантный IgdE _equi расщеплял IgG лошадиной сыворотки, но не IgM или IgA (рис. 3C).
Рис. 3. Протеазы семейства IgdE специфичны для IgG по сравнению с IgM и IgA.
2% свиной плазмы инкубировали с (+) или без (-) 20 мкг / мл очищенного rIgdE _porcinus (A) или 5% растворимой фракции клеток E. coli, экспрессирующих rIgdE _{pseudoporcinus} (B) соответственно в течение 16 часов. при 37 ° С. 2% лошадиную сыворотку инкубировали с 5% растворимой фракцией клеток E. coli, экспрессирующих rIgdE _equi (C), в течение 16 часов при 37 ° C.Реакции анализировали с помощью вестерн-блоттинга против свиного или конского IgG, IgM и IgA в восстанавливающих условиях. Наблюдались только продукты распада IgG (*).

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0164809.g003
Специфичность протеаз IgdE из S . agalactiae и S . pseudoporcinus для человеческого IgG по сравнению с человеческим IgM и IgA тестировали путем инкубации рекомбинантного белка с очищенным Ig (все Sigma) и анализировали путем восстановления SDS-PAGE.Результаты показали, что rIgdE _agalactiae (фиг. 4A) и rIgdE _{pseudoporcinus} (фиг. 4B) были специфичными для IgG и расщепленного человеческого IgG, но не для человеческого IgM или IgA.
Рис. 4. IgdE _agalactiae и IgdE _{pseudoporcinus} специфичны для человеческого IgG по сравнению с IgM и IgA.
0,5 мг / мл человеческого IgG, IgM и IgA инкубировали в течение 16 часов при 37 ° C с (+) или без (-) 20 мкг / мл очищенного rIgdE _agalactiae (A) или 5% растворимой фракции E.coli, экспрессирующие rIgdE _{pseudoporcinus} (B). Реакции анализировали с помощью SDS-PAGE в восстанавливающих условиях. SDS-PAGE окрашивали кумасси синим. Порядок полос в SDS-PAGE был скорректирован.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0164809.g004
Подтип IgG специфичность протеаз IgdE
S . agalactiae , S . pseudoporcinus и S . equi subsp. zooepidemicus
Учитывая продемонстрированную специфичность протеаз IgdE к IgG конкретных хозяев, нас интересовала специфичность этих протеаз к подтипу IgG.Поэтому рекомбинантный IgdE _agalactiae (фиг. 5A) и rIgdE _{pseudoporcinus} (фиг. 5B) инкубировали с человеческими IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4 из источника миеломы перед восстановлением анализа SDS-PAGE. И rIgdE _agalactiae, и rIgdE _{pseudoporcinus} были строго IgG1-специфичными, и не наблюдалось деградации человеческих IgG2, IgG3 и IgG4. Специфичность подтипа лошадиного IgG для rIgdE _equi была протестирована путем инкубации препаратов протеазы с очищенными рекомбинантными лошадьми IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgG5, IgG6 и IgG7 (рис. 5C).Поразительно, что выраженная специфичность подтипа наблюдалась также для rIgdE _equi, и из всех подтипов лошадиного IgG расщеплялся только рекомбинантный лошадиный IgG7.
Рис. 5. IgdE _agalactiae, IgdE _{pseudoporcinus} и IgdE _equi являются специфичными к подтипу IgG.
(A) Подтипы человеческого IgG с концентрацией 0,25 мг / мл инкубировали в течение 16 часов при 37 ° C с (+) или без (-) 20 мкг / мл очищенного rIgdE _agalactiae. Реакции анализировали с помощью SDS-PAGE в восстанавливающих условиях.Расщепление IgG (*) происходило только при инкубации с IgG1. SDS-PAGE окрашивали кумасси синим. Порядок полос в SDS-PAGE был скорректирован. (B) Подтипы человеческого IgG 0,25 мг / мл инкубировали в течение 16 часов при 37 ° C с (+) или без (-) 5% растворимой фракции E . Клетки coli , экспрессирующие rIgdE _{pseudoporcinus}. Реакции анализировали с помощью SDS-PAGE в восстанавливающих условиях. Расщепление IgG (*) происходило только при инкубации с IgG1. SDS-PAGE окрашивали кумасси синим.(C) 0,09 мг / мл рекомбинантных подтипов лошадиного IgG инкубировали в течение 16 часов при 37 ° C с (+) или без (-) 5% растворимой фракции клеток E. coli, экспрессирующих rIgdE _equi. Реакции анализировали с помощью SDS-PAGE в восстанавливающих условиях. Расщепление IgG (*) происходило только при инкубации с IgG7. SDS-PAGE окрашивали гель-красителем Coomassie Fluor Orange Protein Gel Stain. Изображения разных параллельных запусков SDS-PAGE были собраны в один рисунок.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0164809.g005
Сайты расщепления протеаз семейства IgdE
Для определения точного сайта расщепления протеаз IgdE в соответствующих субстратных молекулах IgG продукты расщепления 32 кДа, генерируемые IgdE _agalactiae, IgdE _porcinus, IgdE _{pseudoporcinus} и IgdE _equi, подвергали воздействию терминальное секвенирование по Эдману. Все полученные последовательности соответствовали шарнирной области соответствующих молекул IgG (рис. 6А). IgdE _agalactiae и IgdE _{pseudoporcinus} расщепляют оба человеческого IgG1, но сайты расщепления не идентичны и расположены на расстоянии двух остатков друг от друга.IgdE _agalactiae расщепляет тяжелую цепь человеческого IgG1 на два N-конца предполагаемых гомодимерных остатков цистеина с дисульфидной связью; в то время как все другие сайты расщепления протеаз семейства IgdE расположены непосредственно рядом с предполагаемыми гомодимерными остатками цистеина с дисульфидной связью в шарнирных областях IgG. Сайты расщепления, идентифицированные в свином IgG, образованном в результате расщепления как с IgdE _porcinus, так и с IgdE _{pseudoporcinus}, были идентичны и обнаружены в IgG2, IgG4 и IgG6 свиней (фиг. 6B).Однако аналогичные последовательности также можно найти в IgG1 и IgG5. Последовательность, полученная N-концевым секвенированием по Эдману продукта расщепления лошадиного IgG, генерированного IgdE _equi, соответствовала шарнирной области лошадиного IgG7. Аминокислотные последовательности, аналогичные последовательностям, примыкающим к сайту расщепления в IgG7 лошади, различаются для всех других подтипов IgG лошади, что дает обоснование наблюдаемой специфичности подтипа.
Рис. 6. Протеазы семейства IgdE расщепляют IgG в шарнирной области.
(A) Сайты расщепления в молекулах IgG определяли посредством N-концевого секвенирования по Эдману продуктов расщепления 32 кДа IgG, генерируемых протеазами семейства IgdE. Идентифицированные последовательности аминокислот ( жирным шрифтом ) были обнаружены в шарнирных областях соответствующих тяжелых цепей IgG. Гомодимерные остатки цистеина с дисульфидной связью подчеркнуты. Показаны 10 аминокислотных N- и C-концов от идентифицированного сайта расщепления (символ ножниц) соответствующей тяжелой цепи IgG. Свиной IgG4a был выбран в качестве представителя свиного IgG.(B) Последовательности шарнирных областей и прилегающих частей доменов Ch2 и Ch3 подтипов IgG человека, свиньи и лошади были выровнены с использованием T-COFFEE (Version_8.93) [38], чтобы проиллюстрировать разнообразие шарнирных областей. Надежность совмещения, оцениваемая TCS [39], имеет цветовую кодировку (от синего к красному).

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0164809.g006
Обсуждение
На основании идентификации члена-основателя нового семейства цистеиновых протеаз, IgdE из S . suis [2], мы идентифицировали несколько предполагаемых протеаз семейства IgdE посредством поиска гомологии в пределах рода Streptococcus . Расположение генов этих предполагаемых протеаз было законсервировано внутри и в определенной степени также между различными видами Streptococcus , что позволяет предположить, что гены igdE являются частью основного генома, а не мобильными элементами (Таблица 4). Одна последовательность S . suis и два из S . Однако agalactiae имели другие соседние гены, чем другие 22 последовательности S . suis и 16 из S . agalactiae соответственно. Однако предполагаемые последовательности протеаз семейства IgdE были обнаружены только в 55% из S . agalactiae , 46% от S . equi и 81% из S . suis геномов (таблица 3). Это может происходить из-за реального отсутствия гена igdE в некоторых штаммах этих видов или из-за пор, неполных или неверно аннотированных кодирующих последовательностей этих геномов.
Все исследованные протеазы семейства IgdE, за исключением IgdE _{pseudoporcinus}, показали специфичность только в отношении IgG одного вида хозяев.Субстратная специфичность этих протеаз семейства IgdE хорошо коррелирует с известным тропизмом хозяина соответствующих видов Streptococcus . Однако IgdE _agalactiae не расщепляет бычий IgG, несмотря на S . agalactiae является причиной мастита у крупного рогатого скота, помимо того, что является важным патогеном для человека. Наблюдаемое предпочтение субстрата для человеческого IgG1 может отражать тот самый инвазивный для человека S . agalactiae Изоляты представляют собой отдельные подтипы изолятов крупного рогатого скота, как это было предложено в исследовании характеристик изолятов с сопоставлением по времени и географическому положению [40].IgdE _{pseudoporcinus} показал двойную специфичность как в отношении человеческого IgG1, так и свиного IgG (рис. 2). Начиная с S . pseudoporcinus тесно связан с патогеном свиней S . porcinus , специфичность в отношении IgG свиньи неудивительна. Однако удивительно, что IgdE _{pseudoporcinus}, являющийся патогеном человека, развил способность расщеплять человеческий IgG1, несмотря на близкое родство с IgdE _porcinus, который не обладает этой способностью.Таким образом, это кажется выгодным для S . pseudoporcinus , чтобы иметь протеазу, разрушающую человеческий IgG1, что подчеркивает важность IgG1 в иммунных ответах на бактериальные патогены. Мутационные исследования IgdE _{pseudoporcinus} и IgdE _porcinus могут быть способны анализировать остатки, которые опосредуют эту субстратную специфичность.
Мы предполагаем, что субстратная специфичность протеаз семейства IgdE способствует тропизму хозяина некоторых видов Streptococcus .Совместная эволюция стрептококковых условно-патогенных микроорганизмов и их хозяина может быть отражена на молекулярном уровне совместной эволюцией протеаз семейства IgdE и их субстратных молекул тяжелой цепи IgG. Это очень напоминает совместную эволюцию, описанную между IgA и бактериальными белками, нацеленными на IgA, такими как IgA-связывающие белки и IgA-специфические протеазы, где повторяющиеся эпизоды естественного отбора, как предполагается, формируют взаимодействия между IgA и бактериальными белками. , отражая «гонку вооружений» [41, 42].

Специфичность подтипа протеаз семейства IgdE S . agalactiae и S . pseudoporcinus по отношению к человеческому IgG1 и протеазе семейства IgdE S . equi subsp. zooepidemicus по отношению к лошадиному IgG7 поразительно и удивительно (рис. 5). На первый взгляд, эволюционное преимущество стрептококков, обладающих такими специфическими для подтипа IgG протеазами, по сравнению с протеазами с более широкой специфичностью, вызывает недоумение.Однако расщепления этих подтипов IgG может быть достаточно для преодоления ключевых механизмов иммунной защиты в определенных нишах. Например, S . agalactiae — частая причина инвазивных неонатальных инфекций у людей [43], а человеческий IgG1, наряду с IgG3, является основным человеческим Ig, транспортируемым через плацентарный барьер [44]. Таким образом, расщепления человеческого IgG1 может быть достаточно, чтобы избежать опосредованного Ig иммунного ответа у новорожденного человека-хозяина. Более того, целенаправленное нарушение функции IgG7 с помощью S . equi у лошади, вероятно, в значительной степени включает IgG-опосредованную защиту, учитывая, что IgG7 является одним из преобладающих подклассов в сыворотке лошади [45]. Из-за большого разнообразия в шарнирной области различных подтипов IgG [17, 46] также может быть трудно разработать протеазы, разрушающие IgG, с более широкой специфичностью. Поскольку считается, что некоторые подтипы IgG, например человеческий IgG4, опосредуют толерантность [47, 48], условно-патогенным микроорганизмам может быть даже полезно иметь протеазы, неспособные расщеплять эти подтипы IgG.Исследования потенциальной роли IgdE _agalactiae в уклонении от иммунитета у новорожденных и взрослых хозяев в настоящее время продолжаются в нашей группе.
IgdE _equi является третьей протеазой, разрушающей IgG из S . equi subsp. Описан zooepidemicus , наряду с IdeZ1 [5] и IdeZ2 [49]. IgdE _equi является высокоспецифичным для лошадиного IgG7, в то время как IdeZ1 и IdeZ2 обладают более широкой специфичностью, расщепляя IgG нескольких видов хозяев. Обилие генов, кодирующих протеазы, разрушающие IgG, в S . equi subsp. zooepidemicus указывает на особую важность фенотипа расщепления IgG у этого вида. Эти Ig-деградирующие протеазы могут регулироваться различными системами регуляции генов и, таким образом, экспрессироваться на разных стадиях инфекции или колонизации.
Все протеазы семейства IgdE распознают IgG как субстраты, хотя аминокислотные последовательности в сайтах расщепления в соответствующих шарнирных областях весьма разнообразны (рис. 6). Следовательно, предпочтение IgG в качестве субстратов протеаз семейства IgdE может быть обусловлено не только фактическим сайтом расщепления, но также мотивами, лежащими рядом с ним или внутри фрагмента Fc или фрагмента F (ab).Действительно, эта возможность отражает то, что наблюдается с некоторыми протеазами человеческого IgA1 в тех остатках в Fc-области IgA, которые, как было показано, важны для распознавания человеческого IgA1 в качестве субстрата для расщепления [50, 51]. Можно отметить дальнейшие параллели с расщеплением протеазой IgA1 шарнира IgA1 и расщеплением шарниров IgG протеазами семейства IgdE, описанными здесь. Известно, что разные протеазы IgA1 расщепляют различные специфические пептидные связи в шарнирной последовательности IgA1, и данные свидетельствуют о том, что для того, чтобы расщепление происходило, каждая протеаза требует, чтобы области Fab и Fc были разделены определенным числом аминокислот, предположительно обеспечивают соответствующий доступ и ориентацию протеазы [52].Возможно, сходные пространственные соображения могут повлиять на способность членов семейства IgdE расщеплять их соответствующие субстраты и могут дать дополнительное объяснение их исключительной специфичности для определенных подтипов IgG.
IgdE _agalactiae имеет тот же сайт расщепления в человеческом IgG1, что и папаин [53]. Однако по сравнению с папаином IgdE _agalactiae высокоспецифичен для человеческого IgG1 и имеет только один отчетливый сайт расщепления в тяжелой цепи. Интересно, что этот сайт расщепления не является общим для IgdE _{pseudoporcinus}, который вместо этого расщепляет тяжелую цепь на два остатка ближе к С-концу, только на N-конце предполагаемого остатка цистеина с дисульфидной связью предполагаемого гомодимера.Дифференциальные сайты расщепления указывают на то, что нацеливание на IgG1 развивалось независимо в этих двух протеазах, что подчеркивает важность противодействия бактериям IgG1. Сайты расщепления IgdE _porcinus, IgdE _{pseudoporcinus} и IgdE _equi имеют мотив CPxCP, расположенный только на С-конце сайта расщепления. Этот мотив, однако, также может быть обнаружен во многих молекулах тяжелой цепи IgG, которые не являются субстратами какой-либо исследованной протеазы семейства IgdE, что подтверждает идею о том, что специфичность субстрата определяется другими свойствами, а не последовательностями сайтов расщепления.
Протеазы, разрушающие секретируемый Ig, показали себя как защитные антигены в экспериментальных исследованиях вакцины и инфекций с S . suis у свиней [54] и S . equi в лошадях [55]. Таким образом, описанные протеазы IgdE могут быть подходящими мишенями для вакцины. Учитывая гомологию этих протеаз, особенно в областях, близких к активному центру, вакцинация может даже дать перекрестную защиту против нескольких видов Streptococcus .Это особенно желательно в случае S . agalactiae и S . pseudoporcinus у человека и S . suis и S . porcinus у свиней. Антитела, вызванные такими вакцинами, могут как нейтрализовать протеолитическую функцию этих потенциальных факторов иммунного уклонения, так и потенциально опосредовать антителозависимую клеточную цитотоксичность против стрептококкового патогена.
Наконец, протеазы семейства IgdE с ярко выраженной видовой и субтипной специфичностью также могут иметь биотехнологическое или терапевтическое применение, i . и . аналогично тому, что было доказано для расщепляющего IgG фермента S . pyogenes IdeS [56–61].
Благодарности
Кристоф Г. Баумс (Колледж ветеринарной медицины, Лейпцигский университет, Лейпциг, Германия) признателен за любезное предоставление свиной плазмы и S . porcinus и Åsa Gylfe (Департамент клинической микробиологии, Университет Умео, Умео, Швеция) для S . agalactiae . Часть этой работы была запланирована и выполнена платформой Umeå Protein Expertise Platform.Выражаем признательность за поддержку со стороны BILS (Инфраструктура биоинформатики для наук о жизни).
Вклад авторов
Концептуализация: CS UPR.
Формальный анализ: CS.
Получение финансирования: UPR JW.
Исследование: CS PH ML LP.
Методология: CS.
Администрация проекта: UPR.
Ресурсы: UPR JW.
Авторский надзор: UPR JW.
Подтверждение: CS PH.
Визуализация: CS.
Написание — черновик: CS UPR.
Написание — просмотр и редактирование: CS UPR JW.
Список литературы
1.
Факлам Р. Что случилось со стрептококками: обзор таксономических и номенклатурных изменений. Clin Microbiol Rev. 152002. p. 613–30. pmid: 12364372
2.Spoerry C, Seele J, Valentin-Weigand P, Baums CG, von Pawel-Rammingen U. Идентификация и характеристика IgdE, новой разрушающей IgG протеазы Streptococcus suis с уникальной специфичностью для IgG свиней. J Biol Chem. 2016; 291 (15): 7915–25. pmid: 26861873; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC4824999.
3.
Rawlings ND, Waller M, Barrett AJ, Bateman A. MEROPS: база данных протеолитических ферментов, их субстратов и ингибиторов. Nucleic Acids Res. 2014; 42 (выпуск базы данных): D503–9.Epub 2013/10/26. pmid: 24157837; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3964991.
4.
von Pawel-Rammingen U, Johansson BP, Bjorck L. IdeS, новая стрептококковая цистеиновая протеиназа с уникальной специфичностью к иммуноглобулину G. Embo j. 2002. 21 (7): 1607–15. Epub 2002/04/03. pmid: 11927545; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC125946.
5.
Lannergard J, Guss B. IdeE, IgG-эндопептидаза Streptococcus equi ssp. экви . FEMS Microbiol Lett. 2006. 262 (2): 230–5.Epub 2006/08/23. pmid: 16923080.
6.
Килиан М., Местецки Дж., Шрохенлохер РЭ. Патогенные виды рода Haemophilus и Streptococcus pneumoniae продуцируют протеазу иммуноглобулина A1. Заражение иммунной. 1979; 26 (1): 143–149. Epub 1979/10/01. 40878; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC414586. pmid: 40878
7.
Рейнхольдт Дж., Томана М., Мортенсен С.Б., Килиан М. Молекулярные аспекты деградации иммуноглобулина A1 оральными стрептококками. Заражение иммунной.1990. 58 (5): 1186–94. pmid: 2182537; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC258608.
8.
Seele J, Singpiel A, Spoerry C, von Pawel-Rammingen U, Valentin-Weigand P, Baums CG. Идентификация новой специфической для хозяина протеазы IgM в Streptococcus suis . J Bacteriol. 195. США, 2013. п. 930–40. pmid: 23243300
9.
Марковска-Даниэль И., Поморска-Моль М., Пейсак З. Динамические изменения концентраций иммуноглобулинов в молозиве и сыворотке свиней во время родов.Pol J Vet Sci. 2010. 13 (1): 21–7. pmid: 21077427.
10.
Panda S, Ding JL. Природные антитела служат мостом между врожденным и адаптивным иммунитетом. J Immunol. 2015; 194 (1): 13–20. pmid: 25527792.
11.
Schur PH. Подклассы IgG. Историческая перспектива. Monogr Allergy. 1988; 23: 1–11. pmid: 32.
12.
Simister NE. Плацентарный транспорт иммуноглобулина G. Вакцина. 2003. 21 (24): 3365–9. Epub 2003/07/10. pmid: 12850341.
13.
Брюнс П., Ианнасколи Б., Англия П., Манкарди Д.А., Фернандес Н., Жорье С. и др.Специфичность и сродство человеческих рецепторов Fcgamma и их полиморфных вариантов к подклассам человеческого IgG. Кровь. 2009. 113 (16): 3716–25. pmid: 1
92.
14.
Bindon CI, Hale G, Brüggemann M, Waldmann H. Изотипы моноклональных IgG человека различаются по функции активации комплемента на уровне C4, а также C1q. J Exp Med. 1988. 168 (1): 127–42. pmid: 3260935; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC2188986.
15.
Шумакер В.Н., Калькотт М.А., Шпигельберг Х.Л., Мюллер-Эберхард Х.Дж.Ультрацентрифужные исследования связывания IgG разных подклассов с субъединицей Clq первого компонента комплемента. Биохимия. 1976; 15 (23): 5175–81. pmid: 9
. 16.
Тао М.Х., Смит Р.И., Моррисон С.Л. Структурные особенности иммуноглобулина G человека, определяющие изотип-специфические различия в активации комплемента. J Exp Med. 1993. 178 (2): 661–7. pmid: 8340761; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC21.
17.
Видарссон Г., Деккерс Г., Риспенс Т. Подклассы и аллотипы IgG: от структуры к эффекторным функциям.Фронт Иммунол. 2014; 5: 520. pmid: 25368619; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC4202688.
18.
Батлер Дж. Э., Вертц Н. Развитие репертуара антител у плодных и новорожденных поросят. XVII. Пересмотр транскрипции подкласса IgG с акцентом на новый IgG3. J Immunol. 2006. 177 (8): 5480–9. pmid: 17015734.
19.
Батлер JE, Wertz N, Deschacht N, Kacskovics I. Свиной IgG: структура, генетика и эволюция. Иммуногенетика. 2009. 61 (3): 209–30. Epub 2008/12/03. pmid: 148.
20.
Вагнер Б, Миллер Д.К., Лир Т.Л., Антчак Д.Ф. Полная карта константной области гена тяжелой цепи Ig показывает доказательства семи изотипов IgG и IgD у лошади. J Immunol. 2004. 173 (5): 3230–42. pmid: 15322185.
21.
Льюис М.Дж., Вагнер Б., Гав Дж. М.. Различные возможности эффекторной функции семи подклассов лошадиного IgG имеют значение для стратегий вакцинации. Мол Иммунол. 2008. 45 (3): 818–27. Epub 2007/08/03. pmid: 17669496; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC2075531.
22.
Блисс С.Дж., Мэннинг С.Д., Таллман П., Бейкер С.Дж., Перлман М.Д., Маррс С.Ф. и др. Колонизация группы B Streptococcus у мужчин и небеременных студенток университетов: кросс-секционное исследование распространенности. Clin Infect Dis. 2002. 34 (2): 184–90. Epub 2001/12/12. pmid: 11740706.
23.
Ипполито Д.Л., Джеймс В.А., Тиннемор Д., Хуанг Р.Р., Дехарт М.Дж., Уильямс Дж. И др. Распространенность серотипа streptococcus группы B у женщин репродуктивного возраста в военно-медицинском центре третичного уровня по сравнению с глобальным распределением серотипов.BMC Infect Dis. 2010; 10: 336. pmid: 21106080; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3004907.
24.
Ян И, Лю И, Дин И, Йи Л, Ма З, Фань Х и др. Молекулярная характеристика Streptococcus agalactiae , выделенного от мастита крупного рогатого скота в Восточном Китае. PLoS One. 2013; 8 (7): e67755. pmid: 23874442; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3707890.
25.
Сункара Б., Бхимредди С., Лорбер Б., Лефарт П.Р., Хаякава К., Собел Д.Д. и др. Группа B Streptococcus инфекции у небеременных взрослых: роль иммуносупрессии.Int J Infect Dis. 2012; 16 (3): e182–6. pmid: 22236484.
26.
О’Салливан Т., Дружба Р., Блэквелл Т., Перл Д., МакИвен Б., Карман С. и др. Микробиологическая идентификация и анализ миндалин свиней, собранных с туш при убое. Может J Vet Res. 2011; 75 (2): 106–11. pmid: 21731180; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3062919.
27.
Hajtos I, Glavits R, Makrai L, Hallgatone IS, Jochman J. Возникновение гнойного лимфаденита свиней, вызванного Streptococcus porcinus в Венгрии.Мадьяр Аллаторвосок Лапья. 2002. 124 (3): 161–8. WOS: 000174545500005.
28.
Lammler C, Bahr KH. Характеристика Streptococcus porcinus серогруппы P, выделенного от абортированного плода свиньи. Медицинские научные исследования. 1996. 24 (3): 177–8. WOS: A1996UF45700014.
29.
Bekal S, Gaudreau C, Laurence RA, Simoneau E, Raynal L. Streptococcus pseudoporcinus sp nov ., Новый вид, выделенный из мочеполовых путей женщин.Журнал клинической микробиологии. 2006. 44 (7): 2584–6. WOS: 0002300045. pmid: 16825387
30.
Стоунер К.А., Рабе Л.К., Остин М.Н., Мейн Л.А., Хиллиер С.Л. Заболеваемость и эпидемиология Streptococcus pseudoporcinus в половых путях. J Clin Microbiol. 2011. 49 (3): 883–6. Epub 2010/12/31. pmid: 211; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3067687.
31.
Пелконен С., Линдаль С.Б., Суомала П., Кархукорпи Дж., Вуоринен С., Койвула И. и др. Передача инфекции Streptococcus equi подвид zooepidemicus от лошадей к человеку.Emerg Infect Dis. 2013; 19 (7): 1041–8. pmid: 23777752; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3713971.
32.
Тимони Дж. Ф. Патогенные стрептококки лошадей. Vet Res. 2004. 35 (4): 397–409. pmid: 15236673
33.
Йорм Л. Р., Лав Д. Н., Бейли Г. Д., Маккей Г. М., Бриско Д. А.. Генетическая структура популяций бета-гемолитических стрептококков группы C Lancefield от лошадей и их связь с заболеванием. Res Vet Sci. 1994. 57 (3): 292–9. Epub 1994/11/01. pmid: 7871247.
34.Сиверс Ф., Вильм А., Дайнин Д., Гибсон Т. Дж., Карплюс К., Ли В. и др. Быстрая масштабируемая генерация высококачественного выравнивания множественных последовательностей белков с помощью Clustal Omega. Молекулярная системная биология. 2011; 7 (1). pmid: 21988835
35.
Дарриба Д., Табоада Г.Л., Доалло Р., Посада Д. ProtTest 3: быстрый выбор наиболее подходящих моделей эволюции белка. Биоинформатика. 2011. 27 (8): 1164–5. Epub 22.02.2011. pmid: 21335321.
36.
Guindon S, Gascuel O. Простой, быстрый и точный алгоритм для оценки крупных филогений по максимальной вероятности.Syst Biol. 2003. 52 (5): 696–704. Epub 2003/10/08. pmid: 14530136.
37.
Letunic I, Bork P. Interactive Tree Of Life (iTOL): онлайн-инструмент для отображения и аннотации филогенетического дерева. Биоинформатика. 2007. 23 (1): 127–8. Epub 2006/10/20. pmid: 17050570.
38.
Notredame C, Higgins DG, Heringa J. T-Coffee: новый метод быстрого и точного выравнивания множественных последовательностей. J Mol Biol. 2000. 302 (1): 205–17. pmid: 10964570.
39.
Чанг Дж. М., Ди Томмазо П., Нотредэйм С.TCS: новая мера надежности множественного выравнивания последовательностей для оценки точности выравнивания и улучшения реконструкции филогенетического дерева. Mol Biol Evol. 2014. 31 (6): 1625–37. pmid: 24694831.
40.
Сухнананд С., Доган Б., Айоделе М.О., Задокс Р.Н., Кравер М.П., Дюма Н.Б. и др. Молекулярное субтипирование и характеристика изолятов Streptococcus agalactiae крупного рогатого скота и человека. J Clin Microbiol. 2005. 43 (3): 1177–86. pmid: 15750080; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC1081236.
41.Abi-Rached L, Dorighi K, Norman PJ, Yawata M, Parham P. Эпизоды естественного отбора сформировали взаимодействия IgA-Fc с FcalphaRI и бактериальными белками-ловушками. J Immunol. 2007. 178 (12): 7943–54. pmid: 17548632.
42.
Пинейро А., Гав Дж. М., Аби-Рахед Л., Пархам П., Эстевес П. Дж. Вычислительный анализ эволюционной гонки вооружений между иммунитетом млекопитающих, опосредованным иммуноглобулином А, и его подрывом бактериальными патогенами. PLoS One. 2013; 8 (9): e73934. pmid: 24019941; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC3760800.
43.
Bekker V, Bijlsma MW, van de Beek D, Kuijpers TW, van der Ende A. Заболеваемость инвазивной стрептококковой болезнью группы B и распределение генотипов возбудителя у новорожденных в Нидерландах в течение 25 лет: общенациональное эпиднадзорное исследование. Lancet Infect Dis. 2014; 14 (11): 1083–9. Epub 2014/12/03. pmid: 25444407.
44.
Simister NE, Story CM, Chen HL, Hunt JS. Рецептор Fc, транспортирующий IgG, экспрессируется в синцитиотрофобласте плаценты человека. Eur J Immunol.1996. 26 (7): 1527–31. pmid: 8766556.
45.
Шеоран А.С., Тимони Дж.Ф., Холмс М.А., Карзенски С.С., Крисман М.В. Изотипы иммуноглобулинов в сыворотке крови и секретах слизистой оболочки носа и их неонатальный перенос и распределение у лошадей. Am J Vet Res. 2000. 61 (9): 1099–105. Epub 2000/09/08. pmid: 10976743.
46.
Эллисон Дж. У., Берсон Б. Дж., Худ Л. Е.. Нуклеотидная последовательность гена иммунноглобулина Cγ1 человека. Исследования нуклеиновых кислот. 1982; 10 (13): 4071–9. pmid: 6287432
47.Aalberse RC, Stapel SO, Schuurman J, Rispens T. Иммуноглобулин G4: нечетное антитело. Clin Exp Allergy. 2009. 39 (4): 469–77. Epub 2009/02/19. pmid: 19222496.
48.
Jutel M, Akdis CA. Иммунологические механизмы аллерген-специфической иммунотерапии. Аллергия. 2011; 66 (6): 725–32. Epub 2011/04/07. pmid: 21466562.
49.
Hulting G, Flock M, Frykberg L, Lannergård J, Flock JI, Guss B. Две новые эндопептидазы IgG Streptococcus equi . FEMS Microbiol Lett.2009. 298 (1): 44–50. pmid: 19659725.
50.
Чинталачаруву KR, Chuang PD, Dragoman A, Fernandez CZ, Qiu J, Plaut AG и др. Расщепление шарнирной области человеческого иммуноглобулина A1 (IgA1) протеазами IgA1 требует наличия структур в области Fc IgA. Заражение иммунной. 2003. 71 (5): 2563–70. pmid: 12704129; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC153282.
51.
Старший BW, Гав JM. Сайты в домене Ch4 человеческого IgA1, которые влияют на чувствительность к бактериальным протеазам IgA1. J Immunol.2006. 177 (6): 3913–9. pmid: 16951354.
52.
Старший BW, Гав JM. Влияние длины и состава петли на чувствительность человеческого IgA к расщеплению различными бактериальными протеазами IgA1. J Immunol. 2005. 174 (12): 7792–9. pmid: 15944283.
53.
Ван А.С., Ван И.Ю. Сайты расщепления иммуноглобулина IgG1 человека папаином. Иммунохимия. 1977. 14 (3): 197–200. Epub 1977/03/01. pmid: 863464.
54.
Seele J, Hillermann LM, Beineke A, Seitz M, von Pawel-Rammingen U, Valentin-Weigand P и др.Фермент, разлагающий иммуноглобулин M, из Streptococcus suis , IdeSsuis, представляет собой антиген с высокой защитой против серотипа 2. Вакцина. 2015; 33 (19): 2207–12. pmid: 25825330.
55.
Гусс Б., Флок М., Фрикберг Л., Уоллер А.С., Робинсон С., Смит К.С. и др. Приступаем к борьбе с удушениями: эффективная многокомпонентная рекомбинантная вакцина для защиты лошадей от инфекции, вызванной Streptococcus equi . PLoS Pathog. 2009; 5 (9): e1000584. pmid: 19763180; PubMed Central PMCID: PMCPMC2736577.
56.
Йоханссон Б.П., Шеннон О., Бьорк Л. IdeS: бактериальный протеолитический фермент с терапевтическим потенциалом. PLoS One. 2008; 3 (2): e1692. pmid: 18301769; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC2253494.
57.
Винстедт Л., Ярнум С., Нордаль Е.А., Олссон А., Рунстрём А., Бокерманн Р. и др. Полное удаление внеклеточных антител IgG в рандомизированном исследовании фазы I с увеличением дозы с помощью бактериального фермента IdeS — новая терапевтическая возможность. PLoS One. 2015; 10 (7): e0132011.pmid: 26177518; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC4503742.
58.
Ян Р., Оттен М.А., Хеллмарк Т., Коллин М., Бьорк Л., Чжао М.Х. и др. Успешное лечение экспериментального гломерулонефрита с использованием IdeS и EndoS, стрептококковых ферментов, разрушающих IgG. Пересадка нефрола Dial. 2010. 25 (8): 2479–86. pmid: 20219834.
59.
Такахаши Р., Юки Н. Стрептококковые идеи: терапевтический потенциал синдрома Гийена-Барре. Научный доклад 2015; 5: 10809. pmid: 26194472; Идентификатор PubMed Central PMCID: PMCPMC4508529.
60.
An Y, Zhang Y, Mueller HM, Shameem M, Chen X. Новый инструмент для анализа моноклональных антител: применение протеолиза IdeS для определения характеристик домена IgG.}

деградирующий — это… Что такое деградирующий?

Полезное

Смотреть что такое «деградирующий» в других словарях:

Десятилетие Организации Объединенных Наций, посвященное пустыням и борьбе с опустыниванием

Почему сейчас?

Площадь засушливых земель: значительная часть суши

Продовольственная безопасность: житница мира в опасности

Бедность: отсутствие жизненных удобств

Население: область проживания значительной доли населения мира

Водные ресурсы: вода исчезает, напряжение растет

Биоразнообразие: большое неизвестное

Изменение климата: ненасытные поглотители углерода

Деградация земель: суть вопроса

Факторы, приводящие к деградации земель

Устойчивое управление земельными ресурсами: решение

Список литературы

Анализ закономерностей деградации отдельных государственных высших учебных заведений

О. Мельниченко: Преобразование городских территорий требует поиска баланса интересов органов власти, коммерческих организаций и граждан

Смотрите также

Комиссия Рижской думы по деградирующим среду зданиям классифицировала здание на улице А.Чака 34 как развалину категории В

«Без культуры деградирующие земли не возродить» ::: Хранители Наследия

«Без культуры деградирующие земли не возродить»

Деградирующие игры / Интернет по лампочкам / Безопасный утюг

Аутофагия способствует уклонению иммунной системы от рака поджелудочной железы путем разложения MHC-I

Подверженность унижающему достоинство по сравнению с неуниживающими музыкальными текстами и сексуальным поведением среди молодежи

Аннотация

Определение для изучающих английский язык из словаря учащихся Merriam-Webster

— унижающий достоинство

CDM: Методологии

Описание ошибки

Ошибка сайта

Ошибка сайта

Что такое бесчеловечное и унижающее достоинство обращение?

Что говорят правые?

Как определяются «пытки» и «бесчеловечное и унижающее достоинство обращение»?

Могут ли когда-либо быть оправданы пытки или бесчеловечное обращение?

Но Великобритания никогда не нарушит статью 3, верно?

Изображения: Pixabay.com и Pexels.com.

Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

Настройка вашего браузера для приема файлов cookie

Почему этому сайту требуются файлы cookie?

Что сохраняется в файле cookie?

Новые IgG-деградирующие ферменты семейства протеаз IgdE связывают субстратную специфичность с тропизмом видов Streptococcus-хозяев

Abstract

Введение

Материалы и методы

Вычислительная идентификация новых членов семейства протеаз IgdE в Streptococci

Филогенетический анализ

Штаммы бактерий и условия роста

Клонирование гомологов IgdE для рекомбинантной экспрессии

Экспрессия и очистка рекомбинантных гомологов IgdE

Скрининг на Ig-деградирующую активность рекомбинантных гомологов IgdE

SDS-PAGE и вестерн-блоттинг

N-концевое секвенирование по Эдману

Результаты

Предполагаемые протеазы семейства IgdE распространены среди нескольких видов

Расположение

Протеазы семейства IgdE высокоспецифичны к IgG разных видов хозяев

Подтип IgG специфичность протеаз IgdE

Сайты расщепления протеаз семейства IgdE

Обсуждение

Благодарности

Вклад авторов

Список литературы

Добавить комментарий Отменить ответ